RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF3BO15066 747 aa18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.54■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARID3AQ99856 593 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UACAQ9BZF9 1416 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF16BQ96L93 1317 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC4A10Q6U841 1118 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.52■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM161AQ3B820 660 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF3AQ9Y496 699 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDE4AP27815 886 aa18.46■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.46■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 E9PSI1 815 aa18.46■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.45■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RASSF8Q8NHQ8 419 aa18.44■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AMPHP49418 695 aa18.44■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.44■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PANK3Q9H999 370 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPM3P06753 285 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WIZO95785 1651 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GSE1Q14687 1217 aa18.41■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BQV1 296 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IFFO2Q5TF58 517 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRBNQ96SW2 442 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.39■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.39■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP47Q96K76 1375 aa18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RILPL2Q969X0 211 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CREBRFQ8IUR6 639 aa18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 JPH4Q96JJ6 628 aa18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLIN1O60240 522 aa18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.35■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EVC2Q86UK5 1308 aa18.35■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TOMM22Q9NS69 142 aa18.35■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa18.35■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-207ENST00000428584 G3V3G9 751 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC4A3P48751 1232 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COG3Q96JB2 828 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NGEFQ8N5V2 710 aa18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 REC8O95072 547 aa18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COG6Q9Y2V7 657 aa18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEP89Q96ST8 783 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BECN2A8MW95 431 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ROCK1Q13464 1354 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPM2P07951 284 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MARCH6O60337 910 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPM1P09493 284 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.28■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTPRGP23470 1445 aa18.27■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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