RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 ATP10BO94823 1461 aa22.82■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 UNC13BO14795 1591 aa22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.81■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 NUP155O75694 1391 aa22.8■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 ARID3CA6NKF2 412 aa22.8■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 RALBP1Q15311 655 aa22.8■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 TSPY4P0CV99 314 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 TSPY10P0CW01 314 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-202ENST00000428394 MSH5O43196 834 aa22.76■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.76■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 PLXNC1O60486 1568 aa22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.74■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.72■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.71■■□□□ 1.23
HCLS1-202ENST00000428394 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.7■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 ATP10AO60312 1499 aa22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 PDE3BQ13370 1112 aa22.69■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 TMC1Q8TDI8 760 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.65■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.64■■□□□ 1.22
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC2Q92887 1545 aa22.64■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 NLRP13Q86W25 1043 aa22.62■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.59■■□□□ 1.21
HCLS1-202ENST00000428394 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 ERBINQ96RT1 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 A2MP01023 1474 aa22.54■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.54■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.54■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 STAC3Q96MF2 364 aa22.52■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2R1Q13018 1463 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 BCL11AQ9H165 835 aa22.5■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.48■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 MS4A1P11836 297 aa22.46■■□□□ 1.19
HCLS1-202ENST00000428394 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.44■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 IQGAP1P46940 1657 aa22.44■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.41■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 TMF1P82094 1093 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 SYNMO15061 1565 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 MADDQ8WXG6 1647 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 TESK2Q96S53 571 aa22.39■■□□□ 1.18
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC1P33527 1531 aa22.39■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 CEP152O94986 1710 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 TRPM2O94759 1503 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.37■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 PLCH2O75038 1416 aa22.37■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 SLC24A1O60721 1099 aa22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 CDCA8Q53HL2 280 aa22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 DEPDC5O75140 1603 aa22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.33■■□□□ 1.17
HCLS1-202ENST00000428394 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 TET3O43151 1660 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 PTPRTO14522 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 PIK3C2GO75747 1445 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 ASXL2Q76L83 1435 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-202ENST00000428394 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-202ENST00000428394 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.26■■□□□ 1.15
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