RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPRKQ15262 1439 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRL2O95490 1459 aa38.39■■■■□ 3.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERBINQ96RT1 1412 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.34■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.32■■■■□ 3.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSPA2P54652 639 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPATQ14207 1427 aa38.31■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.31■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.26■■■■□ 3.72
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC3O15438 1527 aa38.24■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGAEP38570 1179 aa38.23■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ROCK1Q13464 1354 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PZPP20742 1482 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEPDC5O75140 1603 aa38.17■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.17■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP152O94986 1710 aa38.1■■■■□ 3.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.08■■■■□ 3.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNRQ92752 1358 aa38.06■■■■□ 3.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.06■■■■□ 3.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.06■■■■□ 3.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KANK1Q14678 1352 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVK-7P63135 1459 aa37.98■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.97■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STRCQ7RTU9 1775 aa37.95■■■■□ 3.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNC13BO14795 1591 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRP1Q9C000 1473 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAIPQ13075 1403 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLA2R1Q13018 1463 aa37.82■■■■□ 3.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP155O75694 1391 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HFM1A2PYH4 1435 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.77■■■■□ 3.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TET3O43151 1660 aa37.77■■■■□ 3.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOS1P29475 1434 aa37.76■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.76■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPRTO14522 1441 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.75■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PKD2Q13563 968 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNMO15061 1565 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IDI1Q13907 227 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.64■■■■□ 3.62
HOXD-AS2-201ENST00000426965 E9PCH4 1651 aa37.64■■■■□ 3.62
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIK3C2BO00750 1634 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.6■■■■□ 3.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.59■■■■□ 3.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLIT1O75093 1534 aa37.51■■■■□ 3.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM52Q96A61 297 aa37.51■■■■□ 3.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.51■■■■□ 3.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MED14O60244 1454 aa37.51■■■■□ 3.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRB3O60242 1522 aa37.48■■■■□ 3.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.48■■■■□ 3.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LTKP29376 864 aa37.48■■■■□ 3.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CERKQ8TCT0 537 aa37.44■■■■□ 3.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.43■■■■□ 3.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.43■■■■□ 3.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.41■■■■□ 3.58
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.38■■■■□ 3.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EID1Q9Y6B2 187 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQGAP1P46940 1657 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.36■■■■□ 3.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.31■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZFYVE9O95405 1425 aa37.3■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.29■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPM2O94759 1503 aa37.29■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXD1Q16676 465 aa37.26■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO41Q8TF61 875 aa37.26■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.26■■■■□ 3.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.26■■■■□ 3.55
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