RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423421.5

CXorf40A-204, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-204ENST00000423421 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.47■■■□□ 2.47
CXorf40A-204ENST00000423421 KANK1Q14678 1352 aa30.47■■■□□ 2.47
CXorf40A-204ENST00000423421 HRCP23327 699 aa30.44■■■□□ 2.46
CXorf40A-204ENST00000423421 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
CXorf40A-204ENST00000423421 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.42■■■□□ 2.46
CXorf40A-204ENST00000423421 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CXorf40A-204ENST00000423421 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.39■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 TRIM52Q96A61 297 aa30.39■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.38■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.38■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 DEPDC5O75140 1603 aa30.36■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 NUP155O75694 1391 aa30.35■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.34■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 UNC13BO14795 1591 aa30.33■■■□□ 2.45
CXorf40A-204ENST00000423421 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.3■■■□□ 2.44
CXorf40A-204ENST00000423421 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CXorf40A-204ENST00000423421 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.28■■■□□ 2.44
CXorf40A-204ENST00000423421 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.27■■■□□ 2.44
CXorf40A-204ENST00000423421 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.26■■■□□ 2.43
CXorf40A-204ENST00000423421 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.24■■■□□ 2.43
CXorf40A-204ENST00000423421 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.22■■■□□ 2.43
CXorf40A-204ENST00000423421 ABCC3O15438 1527 aa30.22■■■□□ 2.43
CXorf40A-204ENST00000423421 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CXorf40A-204ENST00000423421 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.21■■■□□ 2.43
CXorf40A-204ENST00000423421 MADDQ8WXG6 1647 aa30.21■■■□□ 2.43
CXorf40A-204ENST00000423421 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 ZMYM3Q14202 1370 aa30.19■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 MROH2AA6NES4 1674 aa30.18■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 CEP152O94986 1710 aa30.17■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.15■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 TET3O43151 1660 aa30.15■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.14■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.14■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.14■■■□□ 2.42
CXorf40A-204ENST00000423421 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CXorf40A-204ENST00000423421 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.11■■■□□ 2.41
CXorf40A-204ENST00000423421 PZPP20742 1482 aa30.1■■■□□ 2.41
CXorf40A-204ENST00000423421 PKD2Q13563 968 aa30.1■■■□□ 2.41
CXorf40A-204ENST00000423421 PTPRMP28827 1452 aa30.09■■■□□ 2.41
CXorf40A-204ENST00000423421 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.05■■■□□ 2.4
CXorf40A-204ENST00000423421 NPATQ14207 1427 aa30.05■■■□□ 2.4
CXorf40A-204ENST00000423421 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CXorf40A-204ENST00000423421 C3P01024 1663 aa30.04■■■□□ 2.4
CXorf40A-204ENST00000423421 E9PCH4 1651 aa30■■■□□ 2.39
CXorf40A-204ENST00000423421 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CXorf40A-204ENST00000423421 ERVK-7P63135 1459 aa29.96■■■□□ 2.39
CXorf40A-204ENST00000423421 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.94■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 TNRQ92752 1358 aa29.94■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.94■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.94■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 NOS1P29475 1434 aa29.92■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 FOXD1Q16676 465 aa29.91■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 PTPRTO14522 1441 aa29.9■■■□□ 2.38
CXorf40A-204ENST00000423421 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.89■■■□□ 2.37
CXorf40A-204ENST00000423421 NLRP1Q9C000 1473 aa29.85■■■□□ 2.37
CXorf40A-204ENST00000423421 TRPM2O94759 1503 aa29.85■■■□□ 2.37
CXorf40A-204ENST00000423421 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.84■■■□□ 2.37
CXorf40A-204ENST00000423421 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CXorf40A-204ENST00000423421 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.83■■■□□ 2.37
CXorf40A-204ENST00000423421 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.83■■■□□ 2.37
CXorf40A-204ENST00000423421 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.82■■■□□ 2.36
CXorf40A-204ENST00000423421 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CXorf40A-204ENST00000423421 SYNMO15061 1565 aa29.81■■■□□ 2.36
CXorf40A-204ENST00000423421 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.8■■■□□ 2.36
CXorf40A-204ENST00000423421 IDI1Q13907 227 aa29.79■■■□□ 2.36
CXorf40A-204ENST00000423421 PLA2R1Q13018 1463 aa29.78■■■□□ 2.36
CXorf40A-204ENST00000423421 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.75■■■□□ 2.35
CXorf40A-204ENST00000423421 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.75■■■□□ 2.35
CXorf40A-204ENST00000423421 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CXorf40A-204ENST00000423421 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CXorf40A-204ENST00000423421 PIK3C2BO00750 1634 aa29.74■■■□□ 2.35
CXorf40A-204ENST00000423421 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.71■■■□□ 2.35
CXorf40A-204ENST00000423421 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
CXorf40A-204ENST00000423421 CLTCL1P53675 1640 aa29.7■■■□□ 2.34
CXorf40A-204ENST00000423421 KIF1BO60333 1816 aa29.69■■■□□ 2.34
CXorf40A-204ENST00000423421 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CXorf40A-204ENST00000423421 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CXorf40A-204ENST00000423421 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CXorf40A-204ENST00000423421 ADGRB3O60242 1522 aa29.65■■■□□ 2.34
CXorf40A-204ENST00000423421 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CXorf40A-204ENST00000423421 NEUROD1Q13562 356 aa29.62■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.61■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.6■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.6■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.6■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 RGL3Q3MIN7 710 aa29.59■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.59■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 EID1Q9Y6B2 187 aa29.59■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.58■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
CXorf40A-204ENST00000423421 STAC3Q96MF2 364 aa29.55■■■□□ 2.32
CXorf40A-204ENST00000423421 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.55■■■□□ 2.32
CXorf40A-204ENST00000423421 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.55■■■□□ 2.32
CXorf40A-204ENST00000423421 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.54■■■□□ 2.32
CXorf40A-204ENST00000423421 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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