RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 NCOA1Q15788 1441 aa27.55■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 ERBINQ96RT1 1412 aa27.55■■■□□ 2
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SEMA3B-201ENST00000416295 ERVK-7P63135 1459 aa27.19■■□□□ 1.94
SEMA3B-201ENST00000416295 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.19■■□□□ 1.94
SEMA3B-201ENST00000416295 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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SEMA3B-201ENST00000416295 CERKQ8TCT0 537 aa27.18■■□□□ 1.94
SEMA3B-201ENST00000416295 HFM1A2PYH4 1435 aa27.17■■□□□ 1.94
SEMA3B-201ENST00000416295 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.16■■□□□ 1.94
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SEMA3B-201ENST00000416295 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.16■■□□□ 1.94
SEMA3B-201ENST00000416295 NLRP1Q9C000 1473 aa27.15■■□□□ 1.94
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SEMA3B-201ENST00000416295 PLA2R1Q13018 1463 aa27.09■■□□□ 1.93
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SEMA3B-201ENST00000416295 SYNMO15061 1565 aa26.98■■□□□ 1.91
SEMA3B-201ENST00000416295 E9PCH4 1651 aa26.97■■□□□ 1.91
SEMA3B-201ENST00000416295 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.95■■□□□ 1.91
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIM52Q96A61 297 aa26.95■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.95■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.93■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.93■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 PIK3C2BO00750 1634 aa26.92■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 IDI1Q13907 227 aa26.92■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.91■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.91■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.9■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SEMA3B-201ENST00000416295 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SEMA3B-201ENST00000416295 ADGRB3O60242 1522 aa26.87■■□□□ 1.89
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SEMA3B-201ENST00000416295 SLIT1O75093 1534 aa26.85■■□□□ 1.89
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SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SEMA3B-201ENST00000416295 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.83■■□□□ 1.89
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.82■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.82■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.81■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 MED14O60244 1454 aa26.81■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 EID1Q9Y6B2 187 aa26.8■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 TRPM2O94759 1503 aa26.77■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.77■■□□□ 1.88
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.76■■□□□ 1.87
SEMA3B-201ENST00000416295 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.75■■□□□ 1.87
SEMA3B-201ENST00000416295 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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SEMA3B-201ENST00000416295 IQGAP1P46940 1657 aa26.73■■□□□ 1.87
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SEMA3B-201ENST00000416295 CPS1P31327 1500 aa26.71■■□□□ 1.87
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