RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.27■■■□□ 2.76
SH3BP4-204ENST00000416021 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGAEP38570 1179 aa32.27■■■□□ 2.76
SH3BP4-204ENST00000416021 NPATQ14207 1427 aa32.26■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRKQ15262 1439 aa32.26■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.26■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 ERBINQ96RT1 1412 aa32.25■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 MROH2AA6NES4 1674 aa32.24■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.23■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRL2O95490 1459 aa32.22■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.21■■■□□ 2.75
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.18■■■□□ 2.74
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
SH3BP4-204ENST00000416021 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.15■■■□□ 2.74
SH3BP4-204ENST00000416021 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
SH3BP4-204ENST00000416021 ROCK1Q13464 1354 aa32.13■■■□□ 2.73
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.12■■■□□ 2.73
SH3BP4-204ENST00000416021 PZPP20742 1482 aa32.11■■■□□ 2.73
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC3O15438 1527 aa32.1■■■□□ 2.73
SH3BP4-204ENST00000416021 KANK1Q14678 1352 aa32.1■■■□□ 2.73
SH3BP4-204ENST00000416021 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.09■■■□□ 2.73
SH3BP4-204ENST00000416021 TNRQ92752 1358 aa32.08■■■□□ 2.73
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
SH3BP4-204ENST00000416021 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.01■■■□□ 2.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.97■■■□□ 2.71
SH3BP4-204ENST00000416021 DEPDC5O75140 1603 aa31.97■■■□□ 2.71
SH3BP4-204ENST00000416021 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.95■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.93■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.93■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK-7P63135 1459 aa31.92■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP152O94986 1710 aa31.92■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.91■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.91■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.9■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP1Q9C000 1473 aa31.9■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.89■■■□□ 2.7
SH3BP4-204ENST00000416021 PKD2Q13563 968 aa31.88■■■□□ 2.69
SH3BP4-204ENST00000416021 STRCQ7RTU9 1775 aa31.86■■■□□ 2.69
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP155O75694 1391 aa31.85■■■□□ 2.69
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRTO14522 1441 aa31.83■■■□□ 2.69
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2R1Q13018 1463 aa31.82■■■□□ 2.68
SH3BP4-204ENST00000416021 NAIPQ13075 1403 aa31.81■■■□□ 2.68
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.8■■■□□ 2.68
SH3BP4-204ENST00000416021 IDI1Q13907 227 aa31.79■■■□□ 2.68
SH3BP4-204ENST00000416021 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.79■■■□□ 2.68
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
SH3BP4-204ENST00000416021 UNC13BO14795 1591 aa31.76■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.75■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.75■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.75■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 NOS1P29475 1434 aa31.75■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 HFM1A2PYH4 1435 aa31.74■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM52Q96A61 297 aa31.7■■■□□ 2.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CERKQ8TCT0 537 aa31.67■■■□□ 2.66
SH3BP4-204ENST00000416021 TET3O43151 1660 aa31.67■■■□□ 2.66
SH3BP4-204ENST00000416021 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.64■■■□□ 2.66
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.64■■■□□ 2.66
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNMO15061 1565 aa31.62■■■□□ 2.65
SH3BP4-204ENST00000416021 LTKP29376 864 aa31.62■■■□□ 2.65
SH3BP4-204ENST00000416021 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
SH3BP4-204ENST00000416021 EID1Q9Y6B2 187 aa31.61■■■□□ 2.65
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.58■■■□□ 2.65
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.57■■■□□ 2.65
SH3BP4-204ENST00000416021 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.57■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3C2BO00750 1634 aa31.57■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 MED14O60244 1454 aa31.56■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 E9PCH4 1651 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO41Q8TF61 875 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.54■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.53■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SLIT1O75093 1534 aa31.53■■■□□ 2.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
SH3BP4-204ENST00000416021 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
SH3BP4-204ENST00000416021 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.48■■■□□ 2.63
SH3BP4-204ENST00000416021 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.47■■■□□ 2.63
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRB3O60242 1522 aa31.45■■■□□ 2.63
SH3BP4-204ENST00000416021 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
SH3BP4-204ENST00000416021 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXD1Q16676 465 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP4-204ENST00000416021 BCANQ96GW7 911 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.39■■■□□ 2.62
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.38■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.37■■■□□ 2.61
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