RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.9■■■□□ 2.38
ATG4B-204ENST00000402096 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.87■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 FOXD1Q16676 465 aa29.87■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.87■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.87■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 NEUROD1Q13562 356 aa29.86■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.86■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 DEPDC5O75140 1603 aa29.86■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 KIF3BO15066 747 aa29.85■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.84■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 PKD2Q13563 968 aa29.83■■■□□ 2.37
ATG4B-204ENST00000402096 KANK1Q14678 1352 aa29.77■■■□□ 2.36
ATG4B-204ENST00000402096 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.76■■■□□ 2.36
ATG4B-204ENST00000402096 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
ATG4B-204ENST00000402096 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
ATG4B-204ENST00000402096 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.75■■■□□ 2.35
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.74■■■□□ 2.35
ATG4B-204ENST00000402096 ATP10AO60312 1499 aa29.73■■■□□ 2.35
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.7■■■□□ 2.35
ATG4B-204ENST00000402096 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.69■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 TET3O43151 1660 aa29.68■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 CEP152O94986 1710 aa29.68■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 TONSLQ96HA7 1378 aa29.67■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 GGT6Q6P531 493 aa29.67■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 E9PCH4 1651 aa29.65■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 REREQ9P2R6 1566 aa29.65■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.64■■■□□ 2.34
ATG4B-204ENST00000402096 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
ATG4B-204ENST00000402096 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.57■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 AGLP35573 1532 aa29.57■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.56■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.55■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.55■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 ABCC3O15438 1527 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.52■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.52■■■□□ 2.32
ATG4B-204ENST00000402096 PLA2R1Q13018 1463 aa29.5■■■□□ 2.31
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
ATG4B-204ENST00000402096 TRPM2O94759 1503 aa29.45■■■□□ 2.31
ATG4B-204ENST00000402096 MLECQ14165 292 aa29.44■■■□□ 2.3
ATG4B-204ENST00000402096 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.44■■■□□ 2.3
ATG4B-204ENST00000402096 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
ATG4B-204ENST00000402096 PTPRTO14522 1441 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG4B-204ENST00000402096 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
ATG4B-204ENST00000402096 NPATQ14207 1427 aa29.4■■■□□ 2.3
ATG4B-204ENST00000402096 CLTCL1P53675 1640 aa29.39■■■□□ 2.3
ATG4B-204ENST00000402096 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.37■■■□□ 2.29
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.33■■■□□ 2.29
ATG4B-204ENST00000402096 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
ATG4B-204ENST00000402096 KIF1BO60333 1816 aa29.32■■■□□ 2.28
ATG4B-204ENST00000402096 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.31■■■□□ 2.28
ATG4B-204ENST00000402096 RGL3Q3MIN7 710 aa29.3■■■□□ 2.28
ATG4B-204ENST00000402096 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.3■■■□□ 2.28
ATG4B-204ENST00000402096 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.29■■■□□ 2.28
ATG4B-204ENST00000402096 NOS1P29475 1434 aa29.25■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.25■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 SYNMO15061 1565 aa29.24■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.24■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.23■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 MROH2AA6NES4 1674 aa29.2■■■□□ 2.27
ATG4B-204ENST00000402096 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.2■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 PIK3C2BO00750 1634 aa29.19■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.19■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 ERVK-7P63135 1459 aa29.17■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.17■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 ZMYM3Q14202 1370 aa29.15■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.14■■■□□ 2.26
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRB3O60242 1522 aa29.13■■■□□ 2.25
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.12■■■□□ 2.25
ATG4B-204ENST00000402096 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.09■■■□□ 2.25
ATG4B-204ENST00000402096 IFT172Q9UG01 1749 aa29.09■■■□□ 2.25
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ATG4B-204ENST00000402096 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.07■■■□□ 2.24
ATG4B-204ENST00000402096 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.05■■■□□ 2.24
ATG4B-204ENST00000402096 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.05■■■□□ 2.24
ATG4B-204ENST00000402096 C3P01024 1663 aa29.05■■■□□ 2.24
ATG4B-204ENST00000402096 PPLO60437 1756 aa29.03■■■□□ 2.24
ATG4B-204ENST00000402096 MADDQ8WXG6 1647 aa29.03■■■□□ 2.24
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.01■■■□□ 2.24
ATG4B-204ENST00000402096 STAC3Q96MF2 364 aa29.01■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.99■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.98■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 MYOM2P54296 1465 aa28.98■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 TNRQ92752 1358 aa28.97■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.95■■■□□ 2.23
ATG4B-204ENST00000402096 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.95■■■□□ 2.23
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