RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 ROCK1Q13464 1354 aa41.65■■■■■ 4.26
FAAP20-204ENST00000400919 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.61■■■■■ 4.25
FAAP20-204ENST00000400919 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
FAAP20-204ENST00000400919 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.56■■■■■ 4.24
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.53■■■■■ 4.24
FAAP20-204ENST00000400919 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZMYM3Q14202 1370 aa41.51■■■■■ 4.24
FAAP20-204ENST00000400919 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.5■■■■■ 4.23
FAAP20-204ENST00000400919 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
FAAP20-204ENST00000400919 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.45■■■■■ 4.23
FAAP20-204ENST00000400919 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.23
FAAP20-204ENST00000400919 KANK1Q14678 1352 aa41.43■■■■■ 4.22
FAAP20-204ENST00000400919 MROH2AA6NES4 1674 aa41.42■■■■■ 4.22
FAAP20-204ENST00000400919 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
FAAP20-204ENST00000400919 C3P01024 1663 aa41.35■■■■■ 4.21
FAAP20-204ENST00000400919 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
FAAP20-204ENST00000400919 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.34■■■■■ 4.21
FAAP20-204ENST00000400919 ABCC3O15438 1527 aa41.32■■■■■ 4.21
FAAP20-204ENST00000400919 NPATQ14207 1427 aa41.31■■■■■ 4.2
FAAP20-204ENST00000400919 DEPDC5O75140 1603 aa41.31■■■■■ 4.2
FAAP20-204ENST00000400919 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
FAAP20-204ENST00000400919 HFM1A2PYH4 1435 aa41.27■■■■■ 4.2
FAAP20-204ENST00000400919 NAIPQ13075 1403 aa41.27■■■■■ 4.2
FAAP20-204ENST00000400919 PZPP20742 1482 aa41.24■■■■■ 4.19
FAAP20-204ENST00000400919 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.2■■■■■ 4.19
FAAP20-204ENST00000400919 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
FAAP20-204ENST00000400919 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.18■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.16■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.15■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 NUP155O75694 1391 aa41.15■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.15■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 UNC13BO14795 1591 aa41.14■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 CEP152O94986 1710 aa41.13■■■■■ 4.18
FAAP20-204ENST00000400919 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.12■■■■■ 4.17
FAAP20-204ENST00000400919 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.12■■■■■ 4.17
FAAP20-204ENST00000400919 TNRQ92752 1358 aa41.11■■■■■ 4.17
FAAP20-204ENST00000400919 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.11■■■■■ 4.17
FAAP20-204ENST00000400919 HSPA2P54652 639 aa41.02■■■■■ 4.16
FAAP20-204ENST00000400919 ERVK-7P63135 1459 aa41.02■■■■■ 4.16
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM52Q96A61 297 aa41.01■■■■■ 4.16
FAAP20-204ENST00000400919 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.01■■■■■ 4.16
FAAP20-204ENST00000400919 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.99■■■■■ 4.15
FAAP20-204ENST00000400919 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
FAAP20-204ENST00000400919 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.98■■■■■ 4.15
FAAP20-204ENST00000400919 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
FAAP20-204ENST00000400919 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.96■■■■■ 4.15
FAAP20-204ENST00000400919 TET3O43151 1660 aa40.95■■■■■ 4.15
FAAP20-204ENST00000400919 NLRP1Q9C000 1473 aa40.95■■■■■ 4.15
FAAP20-204ENST00000400919 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.94■■■■■ 4.14
FAAP20-204ENST00000400919 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.91■■■■■ 4.14
FAAP20-204ENST00000400919 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
FAAP20-204ENST00000400919 NOS1P29475 1434 aa40.85■■■■■ 4.13
FAAP20-204ENST00000400919 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
FAAP20-204ENST00000400919 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
FAAP20-204ENST00000400919 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
FAAP20-204ENST00000400919 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.83■■■■■ 4.13
FAAP20-204ENST00000400919 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.81■■■■■ 4.12
FAAP20-204ENST00000400919 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.77■■■■■ 4.12
FAAP20-204ENST00000400919 IDI1Q13907 227 aa40.76■■■■■ 4.12
FAAP20-204ENST00000400919 E9PCH4 1651 aa40.76■■■■■ 4.12
FAAP20-204ENST00000400919 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.76■■■■■ 4.11
FAAP20-204ENST00000400919 PKD2Q13563 968 aa40.75■■■■■ 4.11
FAAP20-204ENST00000400919 HRCP23327 699 aa40.74■■■■■ 4.11
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
FAAP20-204ENST00000400919 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.72■■■■■ 4.11
FAAP20-204ENST00000400919 SYNMO15061 1565 aa40.71■■■■■ 4.11
FAAP20-204ENST00000400919 PLA2R1Q13018 1463 aa40.7■■■■■ 4.11
FAAP20-204ENST00000400919 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.69■■■■■ 4.1
FAAP20-204ENST00000400919 PTPRTO14522 1441 aa40.64■■■■■ 4.1
FAAP20-204ENST00000400919 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.63■■■■■ 4.09
FAAP20-204ENST00000400919 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.61■■■■■ 4.09
FAAP20-204ENST00000400919 PIK3C2BO00750 1634 aa40.58■■■■■ 4.09
FAAP20-204ENST00000400919 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.55■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 STRCQ7RTU9 1775 aa40.54■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 EID1Q9Y6B2 187 aa40.53■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 FOXD1Q16676 465 aa40.52■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 ADGRB3O60242 1522 aa40.52■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.51■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.51■■■■■ 4.08
FAAP20-204ENST00000400919 TRPM2O94759 1503 aa40.49■■■■■ 4.07
FAAP20-204ENST00000400919 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.49■■■■■ 4.07
FAAP20-204ENST00000400919 SLIT1O75093 1534 aa40.47■■■■■ 4.07
FAAP20-204ENST00000400919 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.46■■■■■ 4.07
FAAP20-204ENST00000400919 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
FAAP20-204ENST00000400919 LTKP29376 864 aa40.41■■■■■ 4.06
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.39■■■■■ 4.06
FAAP20-204ENST00000400919 MED14O60244 1454 aa40.37■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.36■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 CLTCL1P53675 1640 aa40.34■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
FAAP20-204ENST00000400919 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms