RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397835.4

C5orf38-202, Transcript of chromosome 5 open reading frame 38, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene C5orf38, Length 681 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf38-202ENST00000397835 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.42■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 ADGRL2O95490 1459 aa36.42■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 NCOA1Q15788 1441 aa36.41■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 PTPRKQ15262 1439 aa36.4■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.39■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 ERBINQ96RT1 1412 aa36.39■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.39■■■■□ 3.42
C5orf38-202ENST00000397835 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.38■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.36■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 NPATQ14207 1427 aa36.34■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.34■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 HSPA2P54652 639 aa36.33■■■■□ 3.41
C5orf38-202ENST00000397835 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.32■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 ABCC3O15438 1527 aa36.29■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
C5orf38-202ENST00000397835 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 PZPP20742 1482 aa36.24■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ITGAEP38570 1179 aa36.23■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 DEPDC5O75140 1603 aa36.23■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ROCK1Q13464 1354 aa36.21■■■■□ 3.39
C5orf38-202ENST00000397835 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.19■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 CEP152O94986 1710 aa36.17■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.16■■■■□ 3.38
C5orf38-202ENST00000397835 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.12■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 TNRQ92752 1358 aa36.11■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.1■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 KANK1Q14678 1352 aa36.09■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
C5orf38-202ENST00000397835 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.05■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.04■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.04■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 ERVK-7P63135 1459 aa36.04■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.02■■■■□ 3.36
C5orf38-202ENST00000397835 STRCQ7RTU9 1775 aa36■■■■□ 3.35
C5orf38-202ENST00000397835 UNC13BO14795 1591 aa35.98■■■■□ 3.35
C5orf38-202ENST00000397835 NLRP1Q9C000 1473 aa35.95■■■■□ 3.35
C5orf38-202ENST00000397835 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.94■■■■□ 3.34
C5orf38-202ENST00000397835 NAIPQ13075 1403 aa35.9■■■■□ 3.34
C5orf38-202ENST00000397835 PLA2R1Q13018 1463 aa35.89■■■■□ 3.34
C5orf38-202ENST00000397835 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 TET3O43151 1660 aa35.84■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.84■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.84■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.83■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.83■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 HFM1A2PYH4 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
C5orf38-202ENST00000397835 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.82■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 PTPRTO14522 1441 aa35.82■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 NUP155O75694 1391 aa35.81■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 NOS1P29475 1434 aa35.81■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 SYNMO15061 1565 aa35.78■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 FBXO41Q8TF61 875 aa35.77■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 PKD2Q13563 968 aa35.76■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
C5orf38-202ENST00000397835 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.71■■■■□ 3.31
C5orf38-202ENST00000397835 E9PCH4 1651 aa35.71■■■■□ 3.31
C5orf38-202ENST00000397835 PIK3C2BO00750 1634 aa35.7■■■■□ 3.31
C5orf38-202ENST00000397835 IDI1Q13907 227 aa35.68■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.68■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.64■■■■□ 3.3
C5orf38-202ENST00000397835 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.61■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.6■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 ADGRB3O60242 1522 aa35.58■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 SLIT1O75093 1534 aa35.58■■■■□ 3.29
C5orf38-202ENST00000397835 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 MED14O60244 1454 aa35.57■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.56■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 TRIM52Q96A61 297 aa35.55■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.53■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.52■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 LTKP29376 864 aa35.51■■■■□ 3.28
C5orf38-202ENST00000397835 CERKQ8TCT0 537 aa35.5■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.48■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 IQGAP1P46940 1657 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.46■■■■□ 3.27
C5orf38-202ENST00000397835 EID1Q9Y6B2 187 aa35.43■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.39■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
C5orf38-202ENST00000397835 TRPM2O94759 1503 aa35.38■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 ZFYVE9O95405 1425 aa35.37■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.36■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.34■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 CLTCL1P53675 1640 aa35.33■■■■□ 3.25
C5orf38-202ENST00000397835 FOXD1Q16676 465 aa35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms