RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.47■□□□□ 0.55
NME1-NME2-201ENST00000376392 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.47■□□□□ 0.55
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.545e-8■■□□□ 12.4
NME1-NME2-201ENST00000376392 TET3O43151 1660 aa18.44■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 KANK1Q14678 1352 aa18.44■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.43■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.42■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 DIP2BQ9P265 1576 aa18.41■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP10AO60312 1499 aa18.4■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 E9PCH4 1651 aa18.4■□□□□ 0.54
NME1-NME2-201ENST00000376392 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.39■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.39■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.39■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 A2MP01023 1474 aa18.39■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 RICTORQ6R327 1708 aa18.38■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 MIER1Q8N108 512 aa18.38■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.38■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCA6Q8N139 1617 aa18.36■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.35■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEP152O94986 1710 aa18.35■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRPM2O94759 1503 aa18.34■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.33■□□□□ 0.53
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF3BO15066 747 aa18.33■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.33■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLA2R1Q13018 1463 aa18.33■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.31■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 TSPOAP1O95153 1857 aa18.31■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.3■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.3■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.3■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.28■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.28■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTPRTO14522 1441 aa18.27■□□□□ 0.52
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa18.27■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.26■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLTCL1P53675 1640 aa18.26■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.26■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.25■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 LAMC1P11047 1609 aa18.25■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF1BO60333 1816 aa18.25■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.23■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.23■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP47Q96K76 1375 aa18.22■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 RAPGEF3O95398 923 aa18.22■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.22■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-201ENST00000376392 STAC3Q96MF2 364 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANP32CO43423 234 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCC3O15438 1527 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC7Q96M83 1385 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 RGL3Q3MIN7 710 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 REREQ9P2R6 1566 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 MADDQ8WXG6 1647 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 GGT6Q6P531 493 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.14■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 IFT172Q9UG01 1749 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.13■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.12■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 MROH2AA6NES4 1674 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGLP35573 1532 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 NPATQ14207 1427 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCER2I3L3R5 266 aa18.1■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADGRB3O60242 1522 aa18.09■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.09■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYOM2P54296 1465 aa18.09■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.09■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NME1-NME2-201ENST00000376392 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.08■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 IQGAP1P46940 1657 aa18.06■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 PIK3C2BO00750 1634 aa18.05■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPLO60437 1756 aa18.05■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.05■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOS1P29475 1434 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYNMO15061 1565 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-201ENST00000376392 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms