RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

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Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.03■■■□□ 2.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.37■■□□□ 1.65
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.06■■□□□ 1.44
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.83■■□□□ 1.41
NME1-NME2-201ENST00000376392 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.72■■□□□ 1.39
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.71■■□□□ 1.39
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCC9O60706 1549 aa23.65■■□□□ 1.38
NME1-NME2-201ENST00000376392 NACADO15069 1562 aa23.52■■□□□ 1.36
NME1-NME2-201ENST00000376392 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.3■■□□□ 1.32
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCRIBQ14160 1630 aa23.26■■□□□ 1.31
NME1-NME2-201ENST00000376392 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.83■■□□□ 1.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.48■■□□□ 1.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.46■■□□□ 1.19
NME1-NME2-201ENST00000376392 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.39■■□□□ 1.18
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMARCA4P51532 1647 aa22.33■■□□□ 1.17
NME1-NME2-201ENST00000376392 WIZO95785 1651 aa22.27■■□□□ 1.16
NME1-NME2-201ENST00000376392 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NME1-NME2-201ENST00000376392 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.04■■□□□ 1.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.03■■□□□ 1.12
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMARCA2P51531 1590 aa21.93■■□□□ 1.1
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.83■■□□□ 1.09
NME1-NME2-201ENST00000376392 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.82■■□□□ 1.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.77■■□□□ 1.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 HMGXB3Q12766 1538 aa21.7■■□□□ 1.06
NME1-NME2-201ENST00000376392 NCAPD3P42695 1498 aa21.63■■□□□ 1.05
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM41Q8WV44 630 aa21.59■■□□□ 1.05
NME1-NME2-201ENST00000376392 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.46■■□□□ 1.03
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCC8Q09428 1581 aa21.39■■□□□ 1.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRDM2Q13029 1718 aa21.32■■□□□ 1
NME1-NME2-201ENST00000376392 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFTRP13569 1480 aa21.2■□□□□ 0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYNJ1O43426 1573 aa21.17■□□□□ 0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 EEA1Q15075 1411 aa21.14■□□□□ 0.98
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.13■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.13■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOP2BQ02880 1626 aa21.11■□□□□ 0.97
NME1-NME2-201ENST00000376392 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.08■□□□□ 0.96
NME1-NME2-201ENST00000376392 SOGA1O94964 1423 aa20.97■□□□□ 0.95
NME1-NME2-201ENST00000376392 CUX1P39880 1505 aa20.95■□□□□ 0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.95■□□□□ 0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.88■□□□□ 0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.88■□□□□ 0.93
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NME1-NME2-201ENST00000376392 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.86■□□□□ 0.93
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NME1-NME2-201ENST00000376392 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.81■□□□□ 0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 NESP48681 1621 aa20.79■□□□□ 0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.79■□□□□ 0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.79■□□□□ 0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.74■□□□□ 0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.74■□□□□ 0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF27Q86VH2 1401 aa20.73■□□□□ 0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.71■□□□□ 0.91
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.68■□□□□ 0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOPBP1Q92547 1522 aa20.68■□□□□ 0.9
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.67■□□□□ 0.9
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NME1-NME2-201ENST00000376392 CUX2O14529 1486 aa20.61■□□□□ 0.89
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRXQ9BXM0 1461 aa20.59■□□□□ 0.89
NME1-NME2-201ENST00000376392 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NME1-NME2-201ENST00000376392 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.57■□□□□ 0.88
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NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.54■□□□□ 0.88
NME1-NME2-201ENST00000376392 WDR97A6NE52 1622 aa20.53■□□□□ 0.88
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NME1-NME2-201ENST00000376392 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.46■□□□□ 0.87
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NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.4■□□□□ 0.86
NME1-NME2-201ENST00000376392 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.38■□□□□ 0.85
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NME1-NME2-201ENST00000376392 ERCC6Q03468 1493 aa20.33■□□□□ 0.85
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.32■□□□□ 0.84
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.3■□□□□ 0.84
NME1-NME2-201ENST00000376392 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-201ENST00000376392 PBRM1Q86U86 1689 aa20.29■□□□□ 0.84
NME1-NME2-201ENST00000376392 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.28■□□□□ 0.84
NME1-NME2-201ENST00000376392 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 IFT140Q96RY7 1462 aa20.25■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARAP1Q96P48 1450 aa20.21■□□□□ 0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 APLP2Q06481 763 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.17■□□□□ 0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRIN2BQ13224 1484 aa20.14■□□□□ 0.81
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADAMTS12P58397 1594 aa20.13■□□□□ 0.81
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