RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.81■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 PKD2Q13563 968 aa24.79■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 KIF14Q15058 1648 aa24.79■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 NLRP13Q86W25 1043 aa24.78■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 C8orf34Q49A92 452 aa24.73■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.73■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.73■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 IQGAP2Q13576 1575 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 RGS3P49796 1198 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 FAM161AQ3B820 660 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.71■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 GRIN2AQ12879 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.68■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.66■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 POGKQ9P215 609 aa24.64■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.61■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 SYNJ2O15056 1496 aa24.6■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 E9PCH4 1651 aa24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 ARXQ96QS3 562 aa24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 CEP170Q5SW79 1584 aa24.54■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 NUP155O75694 1391 aa24.52■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.52■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 DISP1Q96F81 1524 aa24.5■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.5■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.49■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.49■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 PANK3Q9H999 370 aa24.48■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.47■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.47■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA0556O60303 1618 aa24.46■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.46■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 SEC24BO95487 1268 aa24.45■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 JPH4Q96JJ6 628 aa24.45■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 USP19O94966 1318 aa24.45■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.45■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.45■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.44■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 RGL3Q3MIN7 710 aa24.43■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.42■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.42■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 NUP160Q12769 1436 aa24.41■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.41■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA2Q08379 1002 aa24.39■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 IGHDP01880 384 aa24.39■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.499e-15■□□□□ 10.1
PRPF39-201ENST00000355765 BCAR3O75815 825 aa24.36■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 BECN1Q14457 450 aa24.36■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 ADGRL2O95490 1459 aa24.36■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 INSRP06213 1382 aa24.35■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.34■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.33■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 PANK2Q9BZ23 570 aa24.33■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.33■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 TESK2Q96S53 571 aa24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF521Q96K83 1311 aa24.31■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.31■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.3■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.3■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 SLFN5Q08AF3 891 aa24.3■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PPP2R1AP30153 589 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 CHD1O14646 1710 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 ERBINQ96RT1 1412 aa24.26■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 ZMYND15Q9H091 742 aa24.25■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 TMF1P82094 1093 aa24.25■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.23■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms