RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.81■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 PKD2Q13563 968 aa24.79■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 KIF14Q15058 1648 aa24.79■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 NLRP13Q86W25 1043 aa24.78■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 C8orf34Q49A92 452 aa24.73■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.73■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.73■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 IQGAP2Q13576 1575 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 RGS3P49796 1198 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 FAM161AQ3B820 660 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.72■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.71■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRPF39-201ENST00000355765 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 GRIN2AQ12879 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.68■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.66■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 POGKQ9P215 609 aa24.64■■□□□ 1.54
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.61■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 SYNJ2O15056 1496 aa24.6■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 E9PCH4 1651 aa24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 ARXQ96QS3 562 aa24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PRPF39-201ENST00000355765 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 CEP170Q5SW79 1584 aa24.54■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PRPF39-201ENST00000355765 NUP155O75694 1391 aa24.52■■□□□ 1.52
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PRPF39-201ENST00000355765 DISP1Q96F81 1524 aa24.5■■□□□ 1.51
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PRPF39-201ENST00000355765 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.49■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.49■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 PANK3Q9H999 370 aa24.48■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.47■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.47■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA0556O60303 1618 aa24.46■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.46■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 SEC24BO95487 1268 aa24.45■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 JPH4Q96JJ6 628 aa24.45■■□□□ 1.51
PRPF39-201ENST00000355765 USP19O94966 1318 aa24.45■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.45■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.45■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.44■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 RGL3Q3MIN7 710 aa24.43■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.42■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.42■■□□□ 1.5
PRPF39-201ENST00000355765 NUP160Q12769 1436 aa24.41■■□□□ 1.5
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PRPF39-201ENST00000355765 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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PRPF39-201ENST00000355765 IGHDP01880 384 aa24.39■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.499e-15■□□□□ 10.1
PRPF39-201ENST00000355765 BCAR3O75815 825 aa24.36■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 BECN1Q14457 450 aa24.36■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 ADGRL2O95490 1459 aa24.36■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 INSRP06213 1382 aa24.35■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.34■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.33■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 PANK2Q9BZ23 570 aa24.33■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.33■■□□□ 1.49
PRPF39-201ENST00000355765 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 TESK2Q96S53 571 aa24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF521Q96K83 1311 aa24.31■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.31■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.3■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.3■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 SLFN5Q08AF3 891 aa24.3■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 PPP2R1AP30153 589 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 CHD1O14646 1710 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.28■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.27■■□□□ 1.48
PRPF39-201ENST00000355765 ERBINQ96RT1 1412 aa24.26■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 ZMYND15Q9H091 742 aa24.25■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 TMF1P82094 1093 aa24.25■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.23■■□□□ 1.47
PRPF39-201ENST00000355765 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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