RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355091.8

GPAA1-201, Transcript of glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPAA1, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1-201ENST00000355091 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.61■■■□□ 2.17
GPAA1-201ENST00000355091 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.61■■■□□ 2.17
GPAA1-201ENST00000355091 DEPDC5O75140 1603 aa28.61■■■□□ 2.17
GPAA1-201ENST00000355091 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.57■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 KDM5CP41229 1560 aa28.56■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.56■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.55■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 E9PCH4 1651 aa28.54■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
GPAA1-201ENST00000355091 NEO1Q92859 1461 aa28.51■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.51■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 ATP10AO60312 1499 aa28.51■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 KIF3BO15066 747 aa28.5■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.5■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.49■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.49■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 GLI2P10070 1586 aa28.48■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.48■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.47■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.47■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.47■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.47■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.47■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 TET3O43151 1660 aa28.46■■■□□ 2.15
GPAA1-201ENST00000355091 RAPGEF3O95398 923 aa28.44■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 A2MP01023 1474 aa28.44■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.43■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 DIP2BQ9P265 1576 aa28.43■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 ABCA6Q8N139 1617 aa28.43■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.42■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 RGL3Q3MIN7 710 aa28.42■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.41■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 RICTORQ6R327 1708 aa28.41■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 KANK1Q14678 1352 aa28.4■■■□□ 2.14
GPAA1-201ENST00000355091 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.38■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 TRPM2O94759 1503 aa28.37■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 USP47Q96K76 1375 aa28.36■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 PTPRTO14522 1441 aa28.36■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 TSPOAP1O95153 1857 aa28.35■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.34■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 CEP152O94986 1710 aa28.34■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 CCDC7Q96M83 1385 aa28.33■■■□□ 2.13
GPAA1-201ENST00000355091 CLTCL1P53675 1640 aa28.32■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.32■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.31■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.31■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.3■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.3■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.27■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.27■■■□□ 2.12
GPAA1-201ENST00000355091 ANP32CO43423 234 aa28.25■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.25■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 GGT6Q6P531 493 aa28.24■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.23■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.21■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.21■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.21■■■□□ 2.11
GPAA1-201ENST00000355091 ABCC3O15438 1527 aa28.16■■■□□ 2.1
GPAA1-201ENST00000355091 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.16■■■□□ 2.1
GPAA1-201ENST00000355091 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.16■■■□□ 2.1
GPAA1-201ENST00000355091 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.15■■■□□ 2.1
GPAA1-201ENST00000355091 NPATQ14207 1427 aa28.15■■■□□ 2.1
GPAA1-201ENST00000355091 MADDQ8WXG6 1647 aa28.15■■■□□ 2.1
GPAA1-201ENST00000355091 KIF1BO60333 1816 aa28.13■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 CCER2I3L3R5 266 aa28.13■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 LAMC1P11047 1609 aa28.13■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.12■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.11■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.1■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 MROH2AA6NES4 1674 aa28.1■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.08■■■□□ 2.09
GPAA1-201ENST00000355091 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.06■■■□□ 2.08
GPAA1-201ENST00000355091 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GPAA1-201ENST00000355091 IFT172Q9UG01 1749 aa28.04■■■□□ 2.08
GPAA1-201ENST00000355091 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
GPAA1-201ENST00000355091 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GPAA1-201ENST00000355091 ADGRB3O60242 1522 aa28■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 STAC3Q96MF2 364 aa27.99■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 NOS1P29475 1434 aa27.97■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 IQGAP1P46940 1657 aa27.97■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 SYNMO15061 1565 aa27.96■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 MYOM2P54296 1465 aa27.96■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 TESK2Q96S53 571 aa27.95■■■□□ 2.07
GPAA1-201ENST00000355091 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.95■■■□□ 2.06
GPAA1-201ENST00000355091 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.94■■■□□ 2.06
GPAA1-201ENST00000355091 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.94■■■□□ 2.06
GPAA1-201ENST00000355091 REREQ9P2R6 1566 aa27.94■■■□□ 2.06
GPAA1-201ENST00000355091 PIK3C2BO00750 1634 aa27.93■■■□□ 2.06
GPAA1-201ENST00000355091 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms