RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 PLA2R1Q13018 1463 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 MS4A1P11836 297 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 USP35Q9P2H5 1018 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 ATP10AO60312 1499 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 GRIN2AQ12879 1464 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB4-201ENST00000332503 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 SHROOM2Q13796 1616 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 MADDQ8WXG6 1647 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 NLRP1Q9C000 1473 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 CEP152O94986 1710 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 IL27Q8NEV9 243 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 SYNMO15061 1565 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 A2MP01023 1474 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 IFT172Q9UG01 1749 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF521Q96K83 1311 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 SHPRHQ149N8 1683 aa20.2■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.2■□□□□ 0.83
HOXB4-201ENST00000332503 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 PDE4AP27815 886 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 NBR1Q14596 966 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 IFT140Q96RY7 1462 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 RALBP1Q15311 655 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 DEPDC5O75140 1603 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 PDE3BQ13370 1112 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 NUP160Q12769 1436 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.14■□□□□ 0.82
HOXB4-201ENST00000332503 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB4-201ENST00000332503 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXB4-201ENST00000332503 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXB4-201ENST00000332503 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXB4-201ENST00000332503 TESK2Q96S53 571 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXB4-201ENST00000332503 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXB4-201ENST00000332503 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXB4-201ENST00000332503 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 C8orf34Q49A92 452 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 ATP10BO94823 1461 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 USP19O94966 1318 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 PKD2Q13563 968 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXB4-201ENST00000332503 NLRP13Q86W25 1043 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 USP32Q8NFA0 1604 aa20■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 CDCA7LQ96GN5 454 aa20■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 PIK3C2GO75747 1445 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 ERBINQ96RT1 1412 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB4-201ENST00000332503 TRPM2O94759 1503 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 SKAP1Q86WV1 359 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.95■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 ABCA6Q8N139 1617 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 CLTCL1P53675 1640 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.94■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.93■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.781e-8■■□□□ 11.7
HOXB4-201ENST00000332503 NFKBIBQ15653 356 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 TMC1Q8TDI8 760 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 ZMYM3Q14202 1370 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 NEFMP07197 916 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 GSE1Q14687 1217 aa19.92■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 CRBNQ96SW2 442 aa19.91■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 NUP155O75694 1391 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.9■□□□□ 0.78
HOXB4-201ENST00000332503 MROH1Q8NDA8 1641 aa19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms