RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329565.5

SNN-201, Transcript of stannin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNN, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNN-201ENST00000329565 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.36■■□□□ 1.49
SNN-201ENST00000329565 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SNN-201ENST00000329565 MS4A1P11836 297 aa24.33■■□□□ 1.49
SNN-201ENST00000329565 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.33■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.31■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.31■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.3■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 KIF14Q15058 1648 aa24.29■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.28■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.28■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 FBLN2P98095 1184 aa24.27■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 PDE3BQ13370 1112 aa24.27■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.27■■□□□ 1.48
SNN-201ENST00000329565 POGKQ9P215 609 aa24.26■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.25■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 PANK3Q9H999 370 aa24.24■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.22■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.22■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 TSPY4P0CV99 314 aa24.21■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 TSPY10P0CW01 314 aa24.21■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.21■■□□□ 1.47
SNN-201ENST00000329565 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.2■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.19■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.17■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.16■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 DISP1Q96F81 1524 aa24.14■■□□□ 1.46
SNN-201ENST00000329565 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.13■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 PBRM1Q86U86 1689 aa24.13■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.13■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 ADAMTS12P58397 1594 aa24.11■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.1■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.1■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.1■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 FAM161AQ3B820 660 aa24.09■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.09■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 C8orf34Q49A92 452 aa24.09■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 KIAA0556O60303 1618 aa24.08■■□□□ 1.45
SNN-201ENST00000329565 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 ZMYND15Q9H091 742 aa24.07■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.06■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.04■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.04■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 TESK2Q96S53 571 aa24.04■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.04■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 ADGRL2O95490 1459 aa24.03■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.02■■□□□ 1.44
SNN-201ENST00000329565 TMF1P82094 1093 aa24.01■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 BCAR3O75815 825 aa24■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 GOLGA2Q08379 1002 aa24■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 KNSTRNQ9Y448 316 aa24■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 PANK2Q9BZ23 570 aa24■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 SEC24BO95487 1268 aa23.99■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.99■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.99■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 E9PCH4 1651 aa23.98■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 PPP2R1AP30153 589 aa23.97■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.96■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
SNN-201ENST00000329565 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 ERBINQ96RT1 1412 aa23.94■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 APAF1O14727 1248 aa23.94■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 JPH4Q96JJ6 628 aa23.93■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 IGHDP01880 384 aa23.91■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.91■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.91■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 CEP170Q5SW79 1584 aa23.91■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.9■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SNN-201ENST00000329565 NEUROD2Q15784 382 aa23.88■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 GRIN2AQ12879 1464 aa23.88■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.87■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 SLFN5Q08AF3 891 aa23.87■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 PANK1Q8TE04 598 aa23.86■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 COG6Q9Y2V7 657 aa23.86■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.86■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 A2MP01023 1474 aa23.86■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.84■■□□□ 1.41
SNN-201ENST00000329565 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms