RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 PANK3Q9H999 370 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS2-201ENST00000329078 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 SYNJ2O15056 1496 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 SKAP1Q86WV1 359 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 ATP10BO94823 1461 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.41■■□□□ 1.82
SPNS2-201ENST00000329078 CEP170Q5SW79 1584 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS2-201ENST00000329078 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SPNS2-201ENST00000329078 RALBP1Q15311 655 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS2-201ENST00000329078 NLRP13Q86W25 1043 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS2-201ENST00000329078 AFAP1Q8N556 730 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS2-201ENST00000329078 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SPNS2-201ENST00000329078 TMF1P82094 1093 aa26.32■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 NEFMP07197 916 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS2-201ENST00000329078 NEUROD2Q15784 382 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS2-201ENST00000329078 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.22■■□□□ 1.79
SPNS2-201ENST00000329078 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.22■■□□□ 1.79
SPNS2-201ENST00000329078 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.21■■□□□ 1.79
SPNS2-201ENST00000329078 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.21■■□□□ 1.79
SPNS2-201ENST00000329078 KIF3BO15066 747 aa26.2■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 CRBNQ96SW2 442 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 SLC4A3P48751 1232 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 ADGRL2O95490 1459 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 NUP160Q12769 1436 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS2-201ENST00000329078 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 MBD5Q9P267 1494 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 RGS3P49796 1198 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 TESK2Q96S53 571 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 KDM5CP41229 1560 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS2-201ENST00000329078 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 PDE4AP27815 886 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 GGT6Q6P531 493 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 ERBINQ96RT1 1412 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 APAF1O14727 1248 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 PPP2R1AP30153 589 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS2-201ENST00000329078 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 TRAK1Q9UPV9 953 aa26■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 PDE3BQ13370 1112 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 A2MP01023 1474 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 ABCA8O94911 1581 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 ARXQ96QS3 562 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 PLA2R1Q13018 1463 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA2Q08379 1002 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 CDCA8Q53HL2 280 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 BCAR3O75815 825 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS2-201ENST00000329078 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 STK26Q9P289 416 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 KANK1Q14678 1352 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS2-201ENST00000329078 BACH2Q9BYV9 841 aa25.83■■□□□ 1.73
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