RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 PLIN1O60240 522 aa22.98■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.97■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.96■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.95■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 ADGRL2O95490 1459 aa22.95■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 RALBP1Q15311 655 aa22.94■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.94■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC4A3P48751 1232 aa22.93■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 CEP170Q5SW79 1584 aa22.92■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.91■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.91■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 NLRP13Q86W25 1043 aa22.89■■□□□ 1.26
SEPHS1-201ENST00000327347 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ERCC6Q03468 1493 aa22.87■■□□□ 1.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.87■■□□□ 1.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ATP10BO94823 1461 aa22.86■■□□□ 1.25
SEPHS1-201ENST00000327347 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SEPHS1-201ENST00000327347 NEFMP07197 916 aa22.86■■□□□ 1.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PANK3Q9H999 370 aa22.85■■□□□ 1.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.82■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.82■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 PDE4AP27815 886 aa22.82■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 SYNJ2O15056 1496 aa22.81■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.81■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.8■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.8■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 CRBNQ96SW2 442 aa22.79■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.79■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.77■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.77■■□□□ 1.24
SEPHS1-201ENST00000327347 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.76■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.76■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.75■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 TESK2Q96S53 571 aa22.73■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.73■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.72■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 BACH2Q9BYV9 841 aa22.71■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.71■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 PDE3BQ13370 1112 aa22.7■■□□□ 1.23
SEPHS1-201ENST00000327347 PTPRGP23470 1445 aa22.7■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCA8O94911 1581 aa22.69■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 TMF1P82094 1093 aa22.69■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 NUP160Q12769 1436 aa22.68■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.68■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 A2MP01023 1474 aa22.68■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 PLA2R1Q13018 1463 aa22.68■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.67■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 ERBINQ96RT1 1412 aa22.65■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 E9PCH4 1651 aa22.65■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 ARXQ96QS3 562 aa22.65■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.64■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.64■■□□□ 1.22
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.63■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.63■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.62■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.62■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.61■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 RGS3P49796 1198 aa22.59■■□□□ 1.21
SEPHS1-201ENST00000327347 PPP2R1AP30153 589 aa22.57■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 MS4A1P11836 297 aa22.57■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.56■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.56■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.56■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.55■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.55■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SEPHS1-201ENST00000327347 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.51■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.51■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.5■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.49■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA2Q08379 1002 aa22.49■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 APAF1O14727 1248 aa22.47■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 PREX2Q70Z35 1606 aa22.47■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 AFAP1Q8N556 730 aa22.46■■□□□ 1.19
SEPHS1-201ENST00000327347 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.45■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 BCAR3O75815 825 aa22.45■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.44■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.43■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.42■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NEUROD2Q15784 382 aa22.41■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms