RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 NUP155O75694 1391 aa28.92■■■□□ 2.22
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CCDC71-201ENST00000321895 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.9■■■□□ 2.22
CCDC71-201ENST00000321895 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.88■■■□□ 2.21
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CCDC71-201ENST00000321895 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.86■■■□□ 2.21
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CCDC71-201ENST00000321895 ATP10AO60312 1499 aa28.84■■■□□ 2.21
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CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.72■■■□□ 2.19
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CCDC71-201ENST00000321895 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.68■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.67■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.65■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 CEP152O94986 1710 aa28.65■■■□□ 2.18
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CCDC71-201ENST00000321895 ABCC3O15438 1527 aa28.61■■■□□ 2.17
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CCDC71-201ENST00000321895 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 PLA2R1Q13018 1463 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 TONSLQ96HA7 1378 aa28.52■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 PTPRTO14522 1441 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM2O94759 1503 aa28.49■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.48■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.48■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 NPATQ14207 1427 aa28.47■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
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CCDC71-201ENST00000321895 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
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CCDC71-201ENST00000321895 NOS1P29475 1434 aa28.36■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.34■■■□□ 2.13
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CCDC71-201ENST00000321895 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.29■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 KIF1BO60333 1816 aa28.28■■■□□ 2.12
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CCDC71-201ENST00000321895 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.19■■■□□ 2.1
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CCDC71-201ENST00000321895 C3P01024 1663 aa28.15■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 MADDQ8WXG6 1647 aa28.15■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 IDI1Q13907 227 aa28.11■■■□□ 2.09
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CCDC71-201ENST00000321895 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 IFT172Q9UG01 1749 aa28.1■■■□□ 2.09
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CCDC71-201ENST00000321895 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.07■■■□□ 2.08
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CCDC71-201ENST00000321895 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.04■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.03■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.01■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 NLRP1Q9C000 1473 aa27.99■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.99■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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