RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 NBPF8Q3BBV2 869 aa38■■■■□ 3.67
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HOXD8-201ENST00000313173 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.98■■■■□ 3.67
HOXD8-201ENST00000313173 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.97■■■■□ 3.67
HOXD8-201ENST00000313173 KDM5CP41229 1560 aa37.97■■■■□ 3.67
HOXD8-201ENST00000313173 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.95■■■■□ 3.67
HOXD8-201ENST00000313173 PLA2R1Q13018 1463 aa37.93■■■■□ 3.66
HOXD8-201ENST00000313173 TSPOAP1O95153 1857 aa37.93■■■■□ 3.66
HOXD8-201ENST00000313173 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
HOXD8-201ENST00000313173 ATP10AO60312 1499 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
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HOXD8-201ENST00000313173 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXD8-201ENST00000313173 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.89■■■■□ 3.66
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HOXD8-201ENST00000313173 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXD8-201ENST00000313173 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXD8-201ENST00000313173 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXD8-201ENST00000313173 RAPGEF3O95398 923 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXD8-201ENST00000313173 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
HOXD8-201ENST00000313173 E9PCH4 1651 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXD8-201ENST00000313173 TET3O43151 1660 aa37.82■■■■□ 3.65
HOXD8-201ENST00000313173 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.81■■■■□ 3.64
HOXD8-201ENST00000313173 KANK1Q14678 1352 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXD8-201ENST00000313173 A2MP01023 1474 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXD8-201ENST00000313173 KIF3BO15066 747 aa37.77■■■■□ 3.64
HOXD8-201ENST00000313173 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.76■■■■□ 3.64
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.76■■■■□ 3.64
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HOXD8-201ENST00000313173 TRPM2O94759 1503 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA6Q8N139 1617 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXD8-201ENST00000313173 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXD8-201ENST00000313173 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.7■■■■□ 3.63
HOXD8-201ENST00000313173 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
HOXD8-201ENST00000313173 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXD8-201ENST00000313173 PTPRTO14522 1441 aa37.68■■■■□ 3.62
HOXD8-201ENST00000313173 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.67■■■■□ 3.62
HOXD8-201ENST00000313173 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXD8-201ENST00000313173 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.63■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 USP47Q96K76 1375 aa37.61■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.6■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.6■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.59■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 CEP152O94986 1710 aa37.59■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC7Q96M83 1385 aa37.57■■■■□ 3.6
HOXD8-201ENST00000313173 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa37.57■■■■□ 3.6
HOXD8-201ENST00000313173 CLTCL1P53675 1640 aa37.56■■■■□ 3.6
HOXD8-201ENST00000313173 RGL3Q3MIN7 710 aa37.56■■■■□ 3.6
HOXD8-201ENST00000313173 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
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HOXD8-201ENST00000313173 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
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HOXD8-201ENST00000313173 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.46■■■■□ 3.59
HOXD8-201ENST00000313173 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.46■■■■□ 3.59
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HOXD8-201ENST00000313173 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.42■■■■□ 3.58
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC3O15438 1527 aa37.4■■■■□ 3.58
HOXD8-201ENST00000313173 CCER2I3L3R5 266 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXD8-201ENST00000313173 GGT6Q6P531 493 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXD8-201ENST00000313173 MADDQ8WXG6 1647 aa37.36■■■■□ 3.57
HOXD8-201ENST00000313173 STAC3Q96MF2 364 aa37.34■■■■□ 3.57
HOXD8-201ENST00000313173 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
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HOXD8-201ENST00000313173 KIF1BO60333 1816 aa37.33■■■■□ 3.57
HOXD8-201ENST00000313173 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
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HOXD8-201ENST00000313173 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.28■■■■□ 3.56
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HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.21■■■■□ 3.55
HOXD8-201ENST00000313173 IFT172Q9UG01 1749 aa37.21■■■■□ 3.55
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HOXD8-201ENST00000313173 MYOM2P54296 1465 aa37.2■■■■□ 3.55
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.19■■■■□ 3.54
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HOXD8-201ENST00000313173 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.16■■■■□ 3.54
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
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HOXD8-201ENST00000313173 AGLP35573 1532 aa37.13■■■■□ 3.53
HOXD8-201ENST00000313173 IQGAP1P46940 1657 aa37.12■■■■□ 3.53
HOXD8-201ENST00000313173 PIK3C2BO00750 1634 aa37.1■■■■□ 3.53
HOXD8-201ENST00000313173 SYNMO15061 1565 aa37.09■■■■□ 3.53
HOXD8-201ENST00000313173 POLR3GLQ9BT43 218 aa37.08■■■■□ 3.53
HOXD8-201ENST00000313173 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.05■■■■□ 3.52
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