RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.49■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 NUP155O75694 1391 aa29.48■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 AGLP35573 1532 aa29.48■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 DEPDC5O75140 1603 aa29.48■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.47■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.46■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 PZPP20742 1482 aa29.46■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
PPARG-202ENST00000309576 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.32e-7■□□□□ 10.1
PPARG-202ENST00000309576 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PPARG-202ENST00000309576 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.42■■■□□ 2.3
PPARG-202ENST00000309576 GGT6Q6P531 493 aa29.4■■■□□ 2.3
PPARG-202ENST00000309576 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.4■■■□□ 2.3
PPARG-202ENST00000309576 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.39■■■□□ 2.29
PPARG-202ENST00000309576 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PPARG-202ENST00000309576 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.37■■■□□ 2.29
PPARG-202ENST00000309576 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PPARG-202ENST00000309576 KANK1Q14678 1352 aa29.33■■■□□ 2.29
PPARG-202ENST00000309576 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.3■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 PKD2Q13563 968 aa29.29■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 FOXD1Q16676 465 aa29.28■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.28■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.28■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 MLECQ14165 292 aa29.27■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 ABCC3O15438 1527 aa29.27■■■□□ 2.28
PPARG-202ENST00000309576 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.24■■■□□ 2.27
PPARG-202ENST00000309576 TET3O43151 1660 aa29.22■■■□□ 2.27
PPARG-202ENST00000309576 CEP152O94986 1710 aa29.21■■■□□ 2.27
PPARG-202ENST00000309576 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.2■■■□□ 2.27
PPARG-202ENST00000309576 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.19■■■□□ 2.26
PPARG-202ENST00000309576 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PPARG-202ENST00000309576 E9PCH4 1651 aa29.16■■■□□ 2.26
PPARG-202ENST00000309576 NPATQ14207 1427 aa29.16■■■□□ 2.26
PPARG-202ENST00000309576 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.15■■■□□ 2.26
PPARG-202ENST00000309576 PLA2R1Q13018 1463 aa29.14■■■□□ 2.26
PPARG-202ENST00000309576 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.14■■■□□ 2.25
PPARG-202ENST00000309576 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PPARG-202ENST00000309576 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.1■■■□□ 2.25
PPARG-202ENST00000309576 PTPRTO14522 1441 aa29.1■■■□□ 2.25
PPARG-202ENST00000309576 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PPARG-202ENST00000309576 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.08■■■□□ 2.25
PPARG-202ENST00000309576 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PPARG-202ENST00000309576 ZMYM3Q14202 1370 aa29.07■■■□□ 2.24
PPARG-202ENST00000309576 NOS1P29475 1434 aa29.03■■■□□ 2.24
PPARG-202ENST00000309576 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.03■■■□□ 2.24
PPARG-202ENST00000309576 TRPM2O94759 1503 aa29.01■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 NEUROD1Q13562 356 aa29■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.99■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 MADDQ8WXG6 1647 aa28.99■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 MROH2AA6NES4 1674 aa28.99■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.99■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.97■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 ERVK-7P63135 1459 aa28.96■■■□□ 2.23
PPARG-202ENST00000309576 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.94■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 SYNMO15061 1565 aa28.94■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.93■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.92■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 CLTCL1P53675 1640 aa28.91■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 C3P01024 1663 aa28.89■■■□□ 2.22
PPARG-202ENST00000309576 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PPARG-202ENST00000309576 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PPARG-202ENST00000309576 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.86■■■□□ 2.21
PPARG-202ENST00000309576 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.86■■■□□ 2.21
PPARG-202ENST00000309576 PIK3C2BO00750 1634 aa28.86■■■□□ 2.21
PPARG-202ENST00000309576 IDI1Q13907 227 aa28.85■■■□□ 2.21
PPARG-202ENST00000309576 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.84■■■□□ 2.21
PPARG-202ENST00000309576 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.82■■■□□ 2.2
PPARG-202ENST00000309576 TNRQ92752 1358 aa28.82■■■□□ 2.2
PPARG-202ENST00000309576 TONSLQ96HA7 1378 aa28.82■■■□□ 2.2
PPARG-202ENST00000309576 PTPRMP28827 1452 aa28.81■■■□□ 2.2
PPARG-202ENST00000309576 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.8■■■□□ 2.2
PPARG-202ENST00000309576 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.78■■■□□ 2.2
PPARG-202ENST00000309576 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.77■■■□□ 2.2
PPARG-202ENST00000309576 RGL3Q3MIN7 710 aa28.75■■■□□ 2.19
PPARG-202ENST00000309576 ADGRB3O60242 1522 aa28.74■■■□□ 2.19
PPARG-202ENST00000309576 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
PPARG-202ENST00000309576 NLRP1Q9C000 1473 aa28.7■■■□□ 2.19
PPARG-202ENST00000309576 KIF1BO60333 1816 aa28.7■■■□□ 2.18
PPARG-202ENST00000309576 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
PPARG-202ENST00000309576 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.69■■■□□ 2.18
PPARG-202ENST00000309576 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.66■■■□□ 2.18
PPARG-202ENST00000309576 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.66■■■□□ 2.18
PPARG-202ENST00000309576 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.62■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.61■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.6■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.59■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.58■■■□□ 2.17
PPARG-202ENST00000309576 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.58■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 STAC3Q96MF2 364 aa28.57■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.57■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.57■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.56■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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