RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287507.7

BCKDK-202, Transcript of branched chain ketoacid dehydrogenase kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDK, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDK-202ENST00000287507 RAPGEF3O95398 923 aa28.43■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.41■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.4■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.37■■■□□ 2.13
BCKDK-202ENST00000287507 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.37■■■□□ 2.13
BCKDK-202ENST00000287507 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.36■■■□□ 2.13
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BCKDK-202ENST00000287507 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.32■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 KIF3BO15066 747 aa28.31■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 A2MP01023 1474 aa28.28■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 ABCA6Q8N139 1617 aa28.28■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 DEPDC5O75140 1603 aa28.28■■■□□ 2.12
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BCKDK-202ENST00000287507 KANK1Q14678 1352 aa28.27■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.27■■■□□ 2.12
BCKDK-202ENST00000287507 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.22■■■□□ 2.11
BCKDK-202ENST00000287507 PLA2R1Q13018 1463 aa28.22■■■□□ 2.11
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BCKDK-202ENST00000287507 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.2■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.19■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.19■■■□□ 2.1
BCKDK-202ENST00000287507 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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BCKDK-202ENST00000287507 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 GGT6Q6P531 493 aa28.11■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.1■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 PTPRTO14522 1441 aa28.09■■■□□ 2.09
BCKDK-202ENST00000287507 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.09■■■□□ 2.09
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BCKDK-202ENST00000287507 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.06■■■□□ 2.08
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BCKDK-202ENST00000287507 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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BCKDK-202ENST00000287507 TRPM2O94759 1503 aa28.03■■■□□ 2.08
BCKDK-202ENST00000287507 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
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BCKDK-202ENST00000287507 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28■■■□□ 2.07
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BCKDK-202ENST00000287507 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.82■■■□□ 2.04
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BCKDK-202ENST00000287507 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.77■■■□□ 2.04
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BCKDK-202ENST00000287507 MROH2AA6NES4 1674 aa27.7■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.7■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 SYNMO15061 1565 aa27.69■■■□□ 2.02
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BCKDK-202ENST00000287507 LAMC1P11047 1609 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 MADDQ8WXG6 1647 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 ANP32CO43423 234 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 ADGRB3O60242 1522 aa27.67■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.66■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.65■■■□□ 2.02
BCKDK-202ENST00000287507 MYOM2P54296 1465 aa27.65■■■□□ 2.02
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