RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
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GPC1-201ENST00000264039 MRE11P49959 708 aa20.63■□□□□ 0.89
GPC1-201ENST00000264039 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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GPC1-201ENST00000264039 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.62■□□□□ 0.89
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GPC1-201ENST00000264039 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.57■□□□□ 0.88
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GPC1-201ENST00000264039 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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GPC1-201ENST00000264039 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.29■□□□□ 0.84
GPC1-201ENST00000264039 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.29■□□□□ 0.84
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GPC1-201ENST00000264039 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.28■□□□□ 0.84
GPC1-201ENST00000264039 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.28■□□□□ 0.84
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