RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRL2O95490 1459 aa38.7■■■■□ 3.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NEUROD1Q13562 356 aa38.67■■■■□ 3.78
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
CAPNS1-201ENST00000246533 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.66■■■■□ 3.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.66■■■■□ 3.78
CAPNS1-201ENST00000246533 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.66■■■■□ 3.78
CAPNS1-201ENST00000246533 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRMP28827 1452 aa38.61■■■■□ 3.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ROCK1Q13464 1354 aa38.56■■■■□ 3.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ERBINQ96RT1 1412 aa38.54■■■■□ 3.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.49■■■■□ 3.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-201ENST00000246533 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.48■■■■□ 3.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
CAPNS1-201ENST00000246533 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.44■■■■□ 3.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYM3Q14202 1370 aa38.42■■■■□ 3.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C3P01024 1663 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-201ENST00000246533 NAIPQ13075 1403 aa38.4■■■■□ 3.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.39■■■■□ 3.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.38■■■■□ 3.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa38.38■■■■□ 3.73
CAPNS1-201ENST00000246533 DEPDC5O75140 1603 aa38.37■■■■□ 3.73
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.35■■■■□ 3.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP152O94986 1710 aa38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC3O15438 1527 aa38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-201ENST00000246533 HFM1A2PYH4 1435 aa38.31■■■■□ 3.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH2AA6NES4 1674 aa38.31■■■■□ 3.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.27■■■■□ 3.72
CAPNS1-201ENST00000246533 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.23■■■■□ 3.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
CAPNS1-201ENST00000246533 KANK1Q14678 1352 aa38.21■■■■□ 3.71
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC13BO14795 1591 aa38.21■■■■□ 3.71
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.2■■■■□ 3.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.19■■■■□ 3.7
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP155O75694 1391 aa38.18■■■■□ 3.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.17■■■■□ 3.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PZPP20742 1482 aa38.15■■■■□ 3.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
CAPNS1-201ENST00000246533 NPATQ14207 1427 aa38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.12■■■■□ 3.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.09■■■■□ 3.69
CAPNS1-201ENST00000246533 MYT1Q01538 1121 aa38.08■■■■□ 3.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM52Q96A61 297 aa38.07■■■■□ 3.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.07■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA2P54652 639 aa38.06■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.06■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.05■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.04■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.03■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-7P63135 1459 aa38.02■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TNRQ92752 1358 aa38.01■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.01■■■■□ 3.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TET3O43151 1660 aa38■■■■□ 3.67
CAPNS1-201ENST00000246533 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.99■■■■□ 3.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.98■■■■□ 3.67
CAPNS1-201ENST00000246533 E9PCH4 1651 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.96■■■■□ 3.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNMO15061 1565 aa37.88■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NOS1P29475 1434 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MIER1Q8N108 512 aa37.87■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD1Q16676 465 aa37.86■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PKD2Q13563 968 aa37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 IDI1Q13907 227 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-201ENST00000246533 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.82■■■■□ 3.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.81■■■■□ 3.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-201ENST00000246533 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP1Q9C000 1473 aa37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3C2BO00750 1634 aa37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2R1Q13018 1463 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRTO14522 1441 aa37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 STRCQ7RTU9 1775 aa37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.65■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-201ENST00000246533 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.63■■■■□ 3.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPM2O94759 1503 aa37.57■■■■□ 3.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CLTCL1P53675 1640 aa37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRB3O60242 1522 aa37.54■■■■□ 3.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.54■■■■□ 3.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LTKP29376 864 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.48■■■■□ 3.59
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