RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 BACH2Q9BYV9 841 aa22.91■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 NEUROD2Q15784 382 aa22.9■■□□□ 1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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KCNQ1-201ENST00000155840 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.87■■□□□ 1.25
KCNQ1-201ENST00000155840 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
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KCNQ1-201ENST00000155840 DISP1Q96F81 1524 aa22.83■■□□□ 1.25
KCNQ1-201ENST00000155840 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.83■■□□□ 1.25
KCNQ1-201ENST00000155840 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF14Q15058 1648 aa22.82■■□□□ 1.24
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KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.8■■□□□ 1.24
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KCNQ1-201ENST00000155840 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.77■■□□□ 1.24
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KCNQ1-201ENST00000155840 BCAR3O75815 825 aa22.76■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 TMF1P82094 1093 aa22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 KDM5CP41229 1560 aa22.74■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 APAF1O14727 1248 aa22.73■■□□□ 1.23
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KCNQ1-201ENST00000155840 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.72■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTS12P58397 1594 aa22.72■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 MBD5Q9P267 1494 aa22.71■■□□□ 1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 PBRM1Q86U86 1689 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 TESK2Q96S53 571 aa22.7■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 KIAA0556O60303 1618 aa22.69■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP2R1AP30153 589 aa22.67■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.66■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PDE3BQ13370 1112 aa22.66■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GRIN2AQ12879 1464 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GOLGA2Q08379 1002 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
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KCNQ1-201ENST00000155840 ERCC6Q03468 1493 aa22.62■■□□□ 1.21
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KCNQ1-201ENST00000155840 MS4A1P11836 297 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-201ENST00000155840 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.6■■□□□ 1.21
KCNQ1-201ENST00000155840 TNNQ9UQP3 1299 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-201ENST00000155840 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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KCNQ1-201ENST00000155840 SEC24BO95487 1268 aa22.57■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 IGHDP01880 384 aa22.57■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.57■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 ATP10BO94823 1461 aa22.57■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 ERBINQ96RT1 1412 aa22.56■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.56■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM161AQ3B820 660 aa22.55■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 C8orf34Q49A92 452 aa22.55■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 AFAP1Q8N556 730 aa22.55■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.55■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.52■■□□□ 1.2
KCNQ1-201ENST00000155840 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPRGP23470 1445 aa22.5■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 A2MP01023 1474 aa22.49■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 IFT140Q96RY7 1462 aa22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ADGRL2O95490 1459 aa22.46■■□□□ 1.19
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KCNQ1-201ENST00000155840 SLFN5Q08AF3 891 aa22.46■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PLA2R1Q13018 1463 aa22.46■■□□□ 1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CEP170Q5SW79 1584 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-201ENST00000155840 POGKQ9P215 609 aa22.45■■□□□ 1.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.44■■□□□ 1.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-201ENST00000155840 USP35Q9P2H5 1018 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF3BO15066 747 aa22.41■■□□□ 1.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.41■■□□□ 1.18
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