RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000183317.7

Ptprv-210, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprv, Length 6,108 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Chmp3Q9CQ10 224 aa17.89■□□□□ 0.46
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Usp47Q8BY87 1376 aa17.88■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Calcoco2A2A6M5 331 aa17.88■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Irx3P81067 507 aa17.88■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 AU015836B2RUM3 263 aa17.87■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Brpf1B2RRD7 1212 aa17.87■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 WrnO09053 1401 aa17.87■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cgnl1Q6AW69 1298 aa17.87■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tsen2Q6P7W5 460 aa17.87■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Stk31Q99MW1 1018 aa17.87■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa17.86■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pank3Q8R2W9 370 aa17.85■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pibf1E9Q6K3 756 aa17.85■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Atp6v1dP57746 247 aa17.84■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cux1P53564 1515 aa17.83■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 GorabQ8BRM2 368 aa17.82■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pak3Q61036 559 aa17.82■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa17.8■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Usp40Q8BWR4 1235 aa17.8■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Shq1Q7TMX5 569 aa17.79■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 MsnP26041 577 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 RdxP26043 583 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cabp4Q8VHC5 271 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprv-210ENSMUST00000183317 GsdmaQ9EST1 446 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rock1P70335 1354 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Soga1E1U8D0 1418 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ccdc146E9Q9F7 977 aa17.75■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ccdc60Q8C4J0 545 aa17.74■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Inpp5dQ9ES52 1191 aa17.74■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Kif7B7ZNG0 1348 aa17.74■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 ErbinQ80TH2 1402 aa17.74■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Fam184bQ0KK56 942 aa17.74■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tpd52l1O54818 204 aa17.73■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tnnt2P50752 301 aa17.73■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa17.72■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Smc4Q8CG47 1286 aa17.71■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ccer1Q9CQL2 403 aa17.71■□□□□ 0.43
Ptprv-210ENSMUST00000183317 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Mink1Q9JM52 1308 aa17.7■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Dapk1Q80YE7 1442 aa17.7■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 AampJ3QN89 436 aa17.69■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rsph3aQ3UFY4 516 aa17.68■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cspp1B2RX88 1205 aa17.68■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Jph4Q80WT0 628 aa17.68■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Nsd2Q8BVE8 1365 aa17.67■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 AppP12023 770 aa17.67■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ralbp1Q62172 648 aa17.66■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Shroom4Q1W617 1475 aa17.65■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 St18Q80TY4 1045 aa17.65■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Chmp7Q8R1T1 451 aa17.65■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tdrd9Q14BI7 1383 aa17.64■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa17.64■□□□□ 0.42
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ddx11Q6AXC6 880 aa17.64■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Zscan10Q3URR7 782 aa17.64■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa17.63■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa17.63■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ciz1Q8VEH2 845 aa17.63■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Filip1lQ6P6L0 1131 aa17.62■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa17.62■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Fyb1O35601 819 aa17.61■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa17.61■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Nap1l3Q794H2 544 aa17.61■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tceal9Q9DD24 104 aa17.61■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Vps53Q8CCB4 832 aa17.61■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tomm22Q9CPQ3 142 aa17.6■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm21969J3QJZ1 289 aa17.6■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gsto1O09131 240 aa17.6■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 SlkO54988 1233 aa17.59■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 KinQ8K339 391 aa17.59■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa17.58■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Casq1O09165 405 aa17.58■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tpm2P58774 284 aa17.58■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tpm4Q6IRU2 248 aa17.58■□□□□ 0.41
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Evc2Q8K1G2 1220 aa17.58■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ddrgk1Q80WW9 315 aa17.58■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 ChgaP26339 463 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Mical1Q8VDP3 1048 aa17.58■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 ScribQ80U72 1612 aa17.57■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa17.57■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Trim58Q5NCC9 485 aa17.57■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ppm1fQ8CGA0 452 aa17.57■□□□□ 0.4
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Becn1O88597 448 aa17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.2 ms