RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018449.10

Prpf8-201, Transcript of Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf8, Length 7,442 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Ipo9Q91YE6 1041 aa14.82□□□□□ -0.04
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Aebp1Q640N1 1128 aa14.81□□□□□ -0.04
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Srcin1Q9QWI6 1250 aa14.81□□□□□ -0.04
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Krt82Q99M74 516 aa14.8□□□□□ -0.04
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Paf1Q8K2T8 535 aa14.73□□□□□ -0.05
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Stk31Q99MW1 1018 aa14.73□□□□□ -0.05
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 IbspQ61711 324 aa14.7□□□□□ -0.06
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Atp6v1dP57746 247 aa14.69□□□□□ -0.06
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Znf704Q9ERQ3 566 aa14.69□□□□□ -0.06
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 CenpjQ569L8 1344 aa14.69□□□□□ -0.06
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Tpm2P58774 284 aa14.66□□□□□ -0.06
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 St18Q80TY4 1045 aa14.65□□□□□ -0.06
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Tpm1P58771 284 aa14.64□□□□□ -0.07
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Rsph3aQ3UFY4 516 aa14.64□□□□□ -0.07
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Inpp5dQ9ES52 1191 aa14.63□□□□□ -0.07
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Smc4Q8CG47 1286 aa14.63□□□□□ -0.07
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Sytl4Q9R0Q1 673 aa14.62□□□□□ -0.07
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Arhgap35Q91YM2 1499 aa14.62□□□□□ -0.07
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Chmp7Q8R1T1 451 aa14.61□□□□□ -0.07
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Bcl2l13P59017 434 aa14.6□□□□□ -0.07
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Usp40Q8BWR4 1235 aa14.59□□□□□ -0.07
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Casq1O09165 405 aa14.59□□□□□ -0.07
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Prpf8-201ENSMUST00000018449 Cplx2P84086 134 aa14.58□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 CntlnA2AM05 1397 aa14.58□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 GsdmaQ9EST1 446 aa14.58□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Pip4k2bQ80XI4 416 aa14.58□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 AcrbpQ3V140 540 aa14.58□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 March6Q6ZQ89 909 aa14.58□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Nol12Q8BG17 217 aa14.57□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Plekhh2Q8C115 1491 aa14.57□□□□□ -0.08
Prpf8-201ENSMUST00000018449 Cep162Q6ZQ06 1403 aa14.57□□□□□ -0.08
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