Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Gabpb2P81069 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Gabpb2P81069 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Gabpb2P81069 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Gabpb2P81069 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Gabpb2P81069 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gabpb2P81069 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gabpb2P81069 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gabpb2P81069 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Gabpb2P81069 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Gabpb2P81069 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Gabpb2P81069 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Gabpb2P81069 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gabpb2P81069 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Gabpb2P81069 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Gabpb2P81069 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Gabpb2P81069 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gabpb2P81069 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Gabpb2P81069 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gabpb2P81069 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gabpb2P81069 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gabpb2P81069 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gabpb2P81069 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gabpb2P81069 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gabpb2P81069 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gabpb2P81069 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gabpb2P81069 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Gabpb2P81069 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Gabpb2P81069 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Gabpb2P81069 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gabpb2P81069 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Gabpb2P81069 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gabpb2P81069 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Gabpb2P81069 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gabpb2P81069 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gabpb2P81069 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gabpb2P81069 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gabpb2P81069 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gabpb2P81069 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Gabpb2P81069 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gabpb2P81069 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gabpb2P81069 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gabpb2P81069 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gabpb2P81069 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Gabpb2P81069 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gabpb2P81069 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gabpb2P81069 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gabpb2P81069 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gabpb2P81069 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gabpb2P81069 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gabpb2P81069 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gabpb2P81069 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Gabpb2P81069 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gabpb2P81069 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Gabpb2P81069 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Gabpb2P81069 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gabpb2P81069 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Gabpb2P81069 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gabpb2P81069 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Gabpb2P81069 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gabpb2P81069 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gabpb2P81069 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gabpb2P81069 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gabpb2P81069 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gabpb2P81069 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gabpb2P81069 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Gabpb2P81069 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gabpb2P81069 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gabpb2P81069 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gabpb2P81069 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gabpb2P81069 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gabpb2P81069 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gabpb2P81069 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gabpb2P81069 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gabpb2P81069 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gabpb2P81069 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gabpb2P81069 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gabpb2P81069 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gabpb2P81069 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gabpb2P81069 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gabpb2P81069 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gabpb2P81069 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gabpb2P81069 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gabpb2P81069 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gabpb2P81069 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gabpb2P81069 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gabpb2P81069 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gabpb2P81069 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gabpb2P81069 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gabpb2P81069 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gabpb2P81069 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gabpb2P81069 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gabpb2P81069 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gabpb2P81069 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Gabpb2P81069 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Gabpb2P81069 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Gabpb2P81069 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gabpb2P81069 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gabpb2P81069 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gabpb2P81069 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms