RNA–Protein interactions for RNA: YPR104C

FHL1, Transcript of Regulator of ribosomal protein (RP) transcription, yeast

Gene FHL1, Length 2,811 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FHL1	YPR104C	HEM15	P16622	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	UBC8	P28263	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SIM1	P40472	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	AGP3	P43548	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	RTT101	P47050	842 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SMP3	Q04174	516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SIA1	Q12212	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	BMT6	Q12291	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	MRPL6	P32904	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	GPI15	P53961	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	PLM2	Q04383	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ASA1	Q06822	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	RKI1	Q12189	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	STE18	P18852	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ECM25	P32525	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	IST2	P38250	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ROT1	Q03691	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SPC2	Q04969	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	CSM4	Q08955	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SNF3	P10870	884 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SNF6	P18888	332 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	MAK32	P23060	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ERG9	P29704	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	MYO3	P36006	1272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	LHS1	P36016	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	MUP1	P50276	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YGL159W	P53110	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	NMA2	P53204	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ASI1	P54074	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	OST6	Q03723	332 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	DLT1	Q04216	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	NUP1	P20676	1076 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	DAL82	P21705	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	PRR1	P28708	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YJR056C	P47115	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	GIS1	Q03833	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YCR102C	P25608	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	SSO1	P32867	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	RIB5	P38145	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YGR168C	P53293	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	CTF19	Q02732	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	THI7	Q05998	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	DXO1	Q06349	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	ERV46	P39727	415 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	JJJ3	P47138	172 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	YGR151C	P53287	111 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	MRS2	Q01926	470 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	LDS2	Q08218	356 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FHL1	YPR104C	TYR1	P20049	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YSR3	P23501	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	NUF2	P33895	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YBR096W	P38256	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	BMT2	P38278	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	AMA1	P50082	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	GND2	P53319	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	USV1	Q12132	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	HTB2	P02294	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
FHL1	YPR104C	IES6	P32617	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	ECM15	P35195	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YBP1	P38315	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YMR262W	P38430	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	SHO1	P40073	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	YIL060W	P40519	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FHL1	YPR104C	SNL1	P40548	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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