RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeastyeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDR2YOL052C-A SSY5P47002 699 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A COS10P52924 374 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A LSG1P53145 640 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A MNT4P53745 580 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A OST6Q03723 332 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A GRX3Q03835 250 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A FIN1Q03898 291 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A SPC19Q03954 165 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A MLC2Q06580 163 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A MCM21Q06675 368 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A LSO1Q3E827 93 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A YOS9Q99220 542 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A DFG16Q99234 619 aa9.98□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A FLP1P03870 423 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A SUR1P33300 382 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A YPK3P38070 525 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A NSG1P38837 291 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A CHL4P38907 458 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A IRC7P43623 340 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A YGR054WP53235 642 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A MPA43P53583 542 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A YMR087WQ04299 284 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A YLR346CQ06139 101 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A RBD2Q12270 262 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A PCL9Q12477 304 aa9.97□□□□□ -0.81
DDR2YOL052C-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A PHO80P20052 293 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A CWH43P25618 953 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A TIM12P32830 109 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YHR035WP38769 630 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A RRP4P38792 359 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YJR115WP47152 169 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A PLM2Q04383 521 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A MRX10Q05648 414 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YDL114WQ07530 308 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YOR389WQ08912 624 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A NPC2Q12408 173 aa9.96□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A DAT1P13483 248 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A HAP4P14064 554 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A ERD1P16151 362 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A STE4P18851 423 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A PRP28P23394 588 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A NDC1P32500 655 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A WBP1P33767 430 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A GPX1P36014 167 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A JEN1P36035 616 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A SKN7P38889 622 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A GDI1P39958 451 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A AIM10P39965 576 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A STB1P42845 420 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A QRI7P43122 407 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A TRS23Q03784 219 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A MDM36Q06820 579 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YOL073CQ08232 322 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A MSH5Q12175 901 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YDL177CQ12257 170 aa9.95□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A MET2P08465 486 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A ARF1P11076 181 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A TEC1P18412 486 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A MDL1P33310 695 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data9.94□□□□□ -0.82not detected
DDR2YOL052C-A JLP2P40206 208 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A BAP3P41815 604 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A CUP9P41817 306 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A SNO3P43544 222 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A RHO5P53879 331 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A DML1Q03652 475 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A PAL1Q05518 499 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A CDA2Q06703 312 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YOR238WQ08634 303 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A MCP1Q12106 302 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A TAD3Q9URQ3 322 aa9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YPT1P01123 206 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A SEC12P11655 471 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A HIS7P33734 552 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YBR139WP38109 508 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A RTC2P38279 296 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A PMT3P47190 753 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A SNO4Q04902 237 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A DCR2Q05924 578 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A AVO1Q08236 1176 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A ENB1Q08299 606 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A BDS1Q08347 646 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A HSP33Q08914 237 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A HSP32Q08992 237 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YDL109CQ12103 647 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YGR161W-CQ3E744 92 aa9.93□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A NCP1P16603 691 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A EMP70P32802 667 aa9.92□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A TRS65P32893 560 aa9.92□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A SLC1P33333 303 aa9.92□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A NIC96P34077 839 aa9.92□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A TPO5P36029 618 aa9.92□□□□□ -0.82
DDR2YOL052C-A YKL071WP36086 256 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms