RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	YMR134W	P40207	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	BIO3	P50277	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	PMT5	P52867	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SOL4	P53315	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	URH1	Q04179	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	IVY1	Q04934	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	LDS2	Q08218	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	UBA3	Q99344	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MSF1	P08425	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	CKI1	P20485	582 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SNC1	P31109	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	TRS65	P32893	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YRB2	P40517	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RTS2	P40962	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	FMP33	P46998	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	PHB2	P50085	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	GPI15	P53961	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	KTR6	P54070	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RHO4	Q00246	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	TIP41	Q12199	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YOS9	Q99220	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SUC2	P00724	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	TPK3	P05986	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	MYO3	P36006	1272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	FAU1	P40099	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YIR014W	P40570	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	HXT9	P40885	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	KAP114	P53067	1004 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	PKP2	P53170	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YKR104W	YKR104W	HXT11	P54862	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR104W	YKR104W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YKR104W	YKR104W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	CTR86	P25355	563 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	UTR4	P32626	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RIM2	P38127	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	FHL1	P39521	936 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SSN8	P47821	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MRPL50	P53724	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	GLO2	Q05584	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	GMC2	Q06201	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	BSC1	Q12140	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SIA1	Q12212	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ATG31	Q12421	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MAS2	P11914	482 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MXR2	P25566	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	POP5	P28005	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YKL162C	P36052	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ECM4	P36156	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YCR041W	P37265	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	HIS2	P38635	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YHR182W	P38870	785 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	PHO90	P39535	881 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	COX16	P47081	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SLT2	Q00772	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	PNG1	Q02890	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	UBX2	Q04228	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	PAM18	Q07914	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	RKM5	Q12367	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	COQ1	P18900	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	BUB3	P26449	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	PPA2	P28239	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	ITR1	P30605	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	MRPS5	P33759	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	COS9	P36034	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	SBE22	P38814	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR104W	YKR104W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	RIP-Chip

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms