RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YER188W	P40103	239 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	AYR1	P40471	297 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YIL029C	P40538	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YIR020C	P40575	100 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SBH2	P52871	88 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RCF2	P53721	224 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	IGO1	P53897	168 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RSM28	Q03430	361 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	EKI1	Q03764	534 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	COX20	Q04935	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	STE23	Q06010	1027 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SET6	Q12529	373 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ENA1	P13587	1091 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SCO1	P23833	295 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	CAF4	P36130	643 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YJL068C	P40363	299 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	PAC10	P48363	199 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	MRK1	P50873	501 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	MRPL19	P53875	158 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	NPC2	Q12408	173 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	REP1	P03871	373 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	DAL80	P26343	269 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	STE14	P32584	239 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YEL043W	P32618	956 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	MOB2	P43563	287 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	FAR3	P46671	204 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	NCA3	P46955	337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	URC2	Q04411	772 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	NAT4	Q04751	285 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YLR036C	Q07986	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RTR2	Q12378	196 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	CDC8	P00572	216 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YCL049C	P25577	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	HEM3	P28789	327 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ECM14	P38836	430 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ABM1	P47146	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	CIK1	Q01649	594 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SKO1	Q02100	647 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	VHS3	Q08438	674 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SRL2	Q12020	392 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	MCP1	Q12106	302 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	UNG1	P12887	359 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	CLB2	P24869	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	DPB3	P27344	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	PPG1	P32838	368 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	CHK1	P38147	527 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	VHR1	P40522	640 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YDR476C	Q03362	224 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RSN1	Q03516	953 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ENB1	Q08299	606 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	UAF30	Q08747	228 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YAL064W-B	O13512	126 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	NUP2	P32499	720 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	DUT1	P33317	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YKL107W	P34251	309 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	EGT2	P42835	1041 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	URB2	P47108	1174 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	YGR126W	P53274	230 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	CRZ1	P53968	678 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	KAP120	Q02932	1032 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RCE1	Q03530	315 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	RAD30	Q04049	632 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	PIN3	Q06449	215 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	JLP1	Q12358	412 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SYF2	YGR129W	MRP13	P12686	339 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	COS9	P36034	407 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	YHR180W	P38868	163 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SYF2	YGR129W	COG3	P40094	801 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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