RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	BNA5	Q05979	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TPO3	Q06451	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	NCA2	Q12374	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ATP6	P00854	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	CDC43	P18898	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	APA2	P22108	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RSM22	P36056	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	MRPL10	P36520	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	LEU5	P38702	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SLM1	P40485	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RMR1	P53060	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	LIF1	P53150	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TIM44	Q01852	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	MSS11	Q03825	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PFA4	Q12006	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	NTE1	Q04958	1679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ERG9	P29704	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	THI80	P35202	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TDA11	P38854	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SIM1	P40472	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YGR210C	P42942	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	THI20	Q08224	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	APC9	Q12107	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SET6	Q12529	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SEY1	Q99287	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
URA7	YBL039C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	STE18	P18852	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YCR100C	P25606	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	CTS1	P29029	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ITR2	P30606	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	NUP2	P32499	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	FRE2	P36033	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RIB1	P38066	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SDS3	P40505	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	KEG1	P43614	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	IRC7	P43623	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	RTT101	P47050	842 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SAM50	P53969	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	KIN4	Q01919	800 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	ALE1	Q08548	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	DAP1	Q12091	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	REV1	P12689	985 aa		4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	MKK1	P32490	508 aa		4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YEF1	P32622	495 aa		4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	PTR2	P32901	601 aa		4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	GIM5	Q04493	163 aa		4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.9	□□□□□ -1.62
URA7	YBL039C	POM152	P39685	1337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RPN13	O13563	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SPO11	P23179	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	STB4	P50104	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YNL234W	P53857	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	IRC15	Q02733	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ODC1	Q03028	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	IRC4	Q03036	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	OST6	Q03723	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	CSM3	Q04659	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	FUS2	Q05670	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	DCR2	Q05924	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	LOT6	Q07923	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RAD9	P14737	1309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	RPO26	P20435	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	ZRT1	P32804	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	PPZ2	P33329	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	SPC34	P36131	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
URA7	YBL039C	DTR1	P38125	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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