RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W BUG1Q12191 341 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W HSP42Q12329 375 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MRX4Q12467 430 aa-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W COX3P00420 269 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W HEM4P06174 275 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W BGL2P15703 313 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W ZRT3P34240 503 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TOM20P35180 183 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TAE1P38340 232 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.24□□□□□ -2.45 RIP-Chip
RDS3YPR094W RRG9P40156 214 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W AIM23P47015 356 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YJR146WP47174 117 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W PMT5P52867 743 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W CAX4P53223 239 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W JJJ1P53863 590 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SCS7Q03529 384 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W COG4Q06096 861 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MMT2Q08970 484 aa-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SEM1O94742 89 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MIR1P23641 311 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YKR015CP36111 568 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W DSE2P38844 325 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YER079WP40052 210 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MMF1P40185 145 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MET18P40469 1032 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SPO22P40511 975 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RMD8P43620 662 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W PIR5P46999 287 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W PIB2P53191 635 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RSC1P53236 928 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W INP1Q03694 420 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W GAS2Q06135 555 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YDL109CQ12103 647 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W IES3Q12345 250 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YOP1Q12402 180 aa-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W DST1P07273 309 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W AAC3P18238 307 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SCO1P23833 295 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W OCA4P25366 362 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TOA2P32774 122 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W NOP4P37838 685 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W CTM1P38818 585 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W EFM3P47163 339 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W COS5P47187 383 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W LSG1P53145 640 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W BNI5P53890 448 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W NUP49Q02199 472 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W KAP120Q02932 1032 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YMR010WQ03687 405 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W VTA1Q06263 330 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SUE1Q06524 206 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W COS7Q07788 383 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W AEP3Q12089 606 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YPL150WQ12152 901 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TY3A-GQ12173 290 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YOR012WQ12351 137 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TY3A-IQ99219 290 aa-0.26□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W GCN4P03069 281 aa-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MCM10P32354 571 aa-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W IST2P38250 946 aa-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W NOP16P40007 231 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SEC27P41811 889 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W STE24P47154 453 aa-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W OCA2P53949 197 aa-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W MMR1Q06324 491 aa-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W GAT3Q07928 141 aa-0.27□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W OPI3P05375 206 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TPK3P05986 398 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W CDC42P19073 191 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W ERG3P32353 365 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W CAB3P36076 571 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.28□□□□□ -2.45not detected
RDS3YPR094W ATM1P40416 690 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YIL054WP40524 105 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W YGL138CP53122 345 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SDS23P53172 527 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W CWC22P53333 577 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W ATG16Q03818 150 aa-0.28□□□□□ -2.45
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