RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C TRX3P25372 127 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BUB3P26449 341 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CWP1P28319 239 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RAD14P28519 371 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C DEP1P31385 405 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data2.09□□□□□ -2.07not detected
GCN4YEL009C KKQ8P36004 724 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FRE2P36033 711 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YCR087C-AP37263 153 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CBP4P37267 147 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPK3P38070 525 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RRN10P38204 145 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TSC10P38342 320 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C AXL2P38928 823 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPI1P43587 155 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PTR3P43606 678 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GTO1P48239 356 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C IMA1P53051 589 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NNF2P53253 936 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YNL140CP53910 189 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C IRC15Q02733 499 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MET31Q03081 177 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ECM11Q04110 302 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SPC24Q04477 213 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YDR124WQ04608 324 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GTB1Q04924 702 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BNA5Q05979 453 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YLR413WQ06689 675 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SGT1Q08446 395 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C UAF30Q08747 228 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LAG2Q92325 660 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SAS5Q99314 248 aa2.09□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UBR1P19812 1950 aa2.09□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SUI3P09064 285 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-FP0CX61 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-GR2P0CX62 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MRP13P12686 339 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PHO81P17442 1178 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C CCA1P21269 546 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SPS22P25380 463 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-CP25383 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PHO91P27514 894 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ADE1P27616 306 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ZIP1P31111 875 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SSE1P32589 693 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SKN1P33336 771 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C VPS21P36017 210 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TRM5P38793 499 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ATG7P38862 630 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SWD1P39706 426 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PHM8P40025 321 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C AYR1P40471 297 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C HPM1P40481 377 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C APQ12P40532 138 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C FMP32P43557 207 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C AIM22P47051 409 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C PUS4P48567 403 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C BIO3P50277 480 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C MIG2P53035 382 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C NRM1P53718 249 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C GTR1Q00582 310 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YMR102CQ03177 834 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-DR2Q03483 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YMR010WQ03687 405 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RRN11Q04712 507 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ROY1Q04847 553 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C STP3Q05937 343 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YLR456WQ06199 204 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YLR030WQ07967 263 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YPR202WQ08993 238 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C NMD4Q12129 218 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YPR022CQ12139 1133 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C BSC1Q12140 328 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YOL107WQ12239 342 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RUP1Q12242 671 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-BQ12260 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-OR2Q12293 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C JLP1Q12358 412 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-DR1Q12392 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-OR1Q12439 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C SKM1Q12469 655 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C TY2A-DR3Q99303 438 aa2.08□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C YPR096CO13587 100 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ATP6P00854 259 aa2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C RAS2P01120 322 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
GCN4YEL009C ARG81P05085 880 aa2.07□□□□□ -2.08
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