RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	PHM8	P40025	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MNT3	P40549	630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YGR210C	P42942	411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	IDS2	P46958	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RPE1	P46969	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RAD17	P48581	401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SPT20	P50875	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	COG7	P53195	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BUD9	P53226	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ERV29	P53337	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	COS1	P53822	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	NIS1	P53939	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	EAR1	Q03212	550 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SPC19	Q03954	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PLM2	Q04383	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RSF1	Q05043	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PDR8	Q06149	701 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TPO3	Q06451	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VPS36	Q06696	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	REX4	Q08237	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DCI1	Q08558	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MDM32	Q12171	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FMP16	Q12497	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MTR10	Q99189	972 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	STE12	P13574	688 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PHO80	P20052	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PRP28	P23394	588 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	LYP1	P32487	611 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
UBX7	YBR273C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DOA1	P36037	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YKL151C	P36059	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SHE1	P38200	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PLB1	P39105	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	AIM2	P39721	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	HPA3	P39979	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VRG4	P40107	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SWM2	P40342	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FMC1	P40491	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YFR020W	P43600	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ECM27	P47144	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VEL1	P53058	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YGL101W	P53144	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	IMO32	P53219	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DID2	P69771	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BOP2	Q06150	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	EAF1	Q06337	982 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SSK1	Q07084	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FRE5	Q08908	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ENV7	Q12003	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VPS68	Q12016	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PUS9	Q12069	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TPO4	Q12256	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	APC2	Q12440	853 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	INH1	P01097	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	GCN4	P03069	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FLP1	P03870	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CAN1	P04817	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FPS1	P23900	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ADE1	P27616	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SNC1	P31109	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PDR3	P33200	976 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SRO77	P38163	1010 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	IFA38	P38286	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PEX28	P38848	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CHL4	P38907	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ALP1	P38971	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MEP3	P53390	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MTQ1	P53944	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	HXT11	P54862	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RSM28	Q03430	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	OST6	Q03723	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ROY1	Q04847	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FEX1	Q08913	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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