RNA–Protein interactions for RNA: YLR265C

NEJ1, Transcript of Protein involved in regulation of nonhomologous end joining, yeast

Gene NEJ1, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEJ1	YLR265C	ROG1	P53118	685 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	STE7	P06784	515 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	PFF1	P38244	976 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	URC2	Q04411	772 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ASA1	Q06822	443 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	DCI1	Q08558	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	YSC83	P32792	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	DOA1	P36037	715 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	CHL4	P38907	458 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	LTV1	P34078	463 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	HEM14	P40012	539 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	PAC11	P40960	533 aa		3.08	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	PDE2	P06776	526 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	PUT4	P15380	627 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	SOL2	P37262	315 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	HST1	P53685	503 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	VAC7	P53950	1165 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	MSC3	Q05812	728 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	NDL1	Q06568	189 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	GPM3	Q12326	303 aa		3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	WSC4	P38739	605 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	YER184C	P39961	794 aa		3.06	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	PDC2	P32896	925 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	WSS1	P38838	269 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	PEX22	P39718	180 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	CIN2	P46670	268 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	RTT102	P53330	157 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	MEH1	Q02205	184 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	YDR541C	Q03049	344 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	YLR177W	Q06251	628 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	SFM1	Q12314	213 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	MAS2	P11914	482 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	MSP1	P28737	362 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	TOA1	P32773	286 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	LDS2	Q08218	356 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	YOR376W	Q08900	122 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	HMS1	Q12398	434 aa		3.04	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	ANP1	P32629	500 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	YDR115W	Q04598	105 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEJ1	YLR265C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
NEJ1	YLR265C	YGR067C	P53243	804 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	ERO1	Q03103	563 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	IME2	P32581	645 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	SMP1	P38128	452 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	GAT3	Q07928	141 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	AAD15	Q08361	143 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	PRY2	P36110	329 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	MNL1	P38888	796 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	FHL1	P39521	936 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	CIK1	Q01649	594 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	ATP16	Q12165	160 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	HIF1	Q12373	385 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	SMC6	Q12749	1114 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	YOL085C	Q99345	113 aa		3	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	LDS1	P31379	325 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	YHR177W	P38867	453 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	VEL1	P53058	206 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	YMR010W	Q03687	405 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	FSH2	Q05015	223 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	SRO7	Q12038	1033 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	HEM4	P06174	275 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	UNG1	P12887	359 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NEJ1	YLR265C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93

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