RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W BIO3P50277 480 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YPT32P51996 222 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W COG1P53079 417 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GET1P53192 235 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YML131WQ03102 365 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YMR209CQ03648 457 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W VHS1Q03785 461 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MRPL1Q04599 285 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SPO77Q06134 477 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W DGK1Q12382 290 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CMC2Q3E7A4 109 aa3.67□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W STE2D6VTK4 431 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CPR3P25719 182 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YBR137WP38276 179 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ECM10P39987 644 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W AIM23P47015 356 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W IRC18P47056 224 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YJL016WP47072 561 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SOL4P53315 255 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YDR541CQ03049 344 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W PFA4Q12006 378 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YRM1Q12340 786 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CSR2Q12734 1121 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MED11Q99278 115 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TCP1P12612 559 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MET16P18408 261 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SLY1P22213 666 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CAM1P29547 415 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W HYM1P32464 399 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YKL100CP34248 587 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GEX2P36173 615 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GPX2P38143 162 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CDC1P40986 491 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YGR026WP53217 278 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GPI1P53306 609 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RMI1Q02685 241 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YPL068CQ02749 293 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TVP15Q03860 143 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W TAF11Q04226 346 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W IVY1Q04934 453 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SWA2Q06677 668 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GPM3Q12326 303 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YPR1Q12458 312 aa3.66□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YER190C-BP0CX94 160 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CAP2P13517 287 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YUR1P26725 428 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W NDI1P32340 513 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W COT1P32798 439 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YHK8P38776 514 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data3.65□□□□□ -1.82 RIP-Chip
HCA4YJL033W SSO2P39926 295 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MEP1P40260 492 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W PEP8P40335 379 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GTT1P40582 234 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MNN5P46982 586 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W YGR127WP53275 312 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W ARP10Q04549 284 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W MDM32Q12171 622 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W RRI1Q12468 440 aa3.65□□□□□ -1.82
HCA4YJL033W GAL4P04386 881 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ARG81P05085 880 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-FP0CX61 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ARO3P14843 370 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-CP25383 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W UBC8P28263 218 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RNP1P32385 249 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RGT1P32862 1170 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SPT10P35208 640 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RIM2P38127 377 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PRS2P38620 318 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W FLO5P38894 1075 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YIL054WP40524 105 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YGR067CP53243 804 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-DR2Q03483 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GEP3Q08622 556 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-BQ12260 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-OR2Q12293 438 aa3.65□□□□□ -1.83
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