RNA–Protein interactions for RNA: YHR197W

RIX1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene RIX1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIX1	YHR197W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	ICS2	P38284	255 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YPR003C	P53394	754 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YTP1	P53584	459 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RSM23	Q01163	450 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	VIK1	Q12045	647 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	BTS1	Q12051	335 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RAV1	P47104	1357 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RAD7	P06779	565 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	UTR1	P21373	530 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	MXR2	P25566	168 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	FUB1	P25659	250 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	PPZ1	P26570	692 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	PPA2	P28239	310 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YER121W	P40076	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	COA1	P40452	197 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	DIP5	P53388	608 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	MRP51	Q02950	344 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	UBX2	Q04228	584 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	ARP10	Q04549	284 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	NAT4	Q04751	285 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	COQ11	Q05892	277 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	CDD1	Q06549	142 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RAD34	Q06665	692 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RUP1	Q12242	671 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	NCB2	Q92317	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	SEY1	Q99287	776 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	FSH3	Q99369	266 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	GAL4	P04386	881 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RAD1	P06777	1100 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	FAR1	P21268	830 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	CLB2	P24869	491 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YKL071W	P36086	256 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	FHL1	P39521	936 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YGR210C	P42942	411 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	PTR3	P43606	678 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RRN9	P53437	365 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YPL068C	Q02749	293 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	CAC2	Q04199	468 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	ASR1	Q06834	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YLR108C	Q12259	485 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	SUT2	Q12286	268 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	QCR7	P00128	127 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	CTR86	P25355	563 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	MEI4	P29467	408 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	VAM7	P32912	316 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	MRPS5	P33759	307 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	TOD6	P34219	525 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	LHS1	P36016	881 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	HIS2	P38635	335 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YJL163C	P46996	555 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	HOC1	P47124	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	TIS11	P47977	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	NAS6	P50086	228 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	BUD32	P53323	261 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	SED5	Q01590	340 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	ROT1	Q03691	256 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	THP1	Q08231	455 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	IRC13	Q08630	104 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RKI1	Q12189	258 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	CSM1	P25651	190 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	ECM25	P32525	599 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RAD24	P32641	659 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	SHP1	P34223	423 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	MIC12	P38341	106 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YAL037W	P39728	267 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YER184C	P39961	794 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	NDC80	P40460	691 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YFR057W	P43625	151 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	TRS85	P46944	698 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YJR154W	P47181	346 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	MUP1	P50276	574 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YIP3	P53633	176 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YDC1	Q02896	317 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	GIP3	Q03016	1276 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	PLM2	Q04383	521 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	HSP31	Q04432	237 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	ATG26	Q06321	1198 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	RKM5	Q12367	367 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RIX1	YHR197W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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