RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	APC4	Q04601	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AFT2	Q08957	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SPC3	Q12133	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HAP2	P06774	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SNF3	P10870	884 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SEC12	P11655	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ADE1	P27616	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AFG1	P32317	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YET1	P35723	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RGD2	P43556	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CPR7	P47103	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AZR1	P50080	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CRT10	Q08226	957 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GRE1	Q08969	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TPK1	P06244	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	BAR1	P12630	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SNF6	P18888	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PEX4	P29340	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GPI10	P30777	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RNP1	P32385	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SKT5	P34226	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	VBA5	P36172	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AVT5	P38176	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YER121W	P40076	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	QRI7	P43122	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NIT2	P47016	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AAD10	P47182	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NRK1	P53915	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DYN2	Q02647	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RSF1	Q05043	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PEX30	Q06169	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RAD34	Q06665	692 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PET20	Q99373	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	QCR2	P07257	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CDC20	P26309	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	BDH1	P39714	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	VRG4	P40107	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MGS1	P40151	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SSU1	P41930	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PFD1	P46988	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AAT1	Q01802	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ATC1	Q04005	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FMP25	Q08023	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ISA2	Q12425	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CDC9	P04819	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SPO7	P18410	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DAL2	P25335	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ISC10	P32645	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR056W	P38081	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RIB5	P38145	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR284W	P38150	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	BUR6	P40096	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NTA1	P40354	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PRM10	P42946	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SNN1	P48232	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HRD1	Q08109	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MDM32	Q12171	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NGG1	P32494	702 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SSS1	P35179	80 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR013C	P38215	129 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YHR122W	P38829	231 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FKH1	P40466	484 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YKE4	P40544	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NMA2	P53204	395 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GND2	P53319	492 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SPC98	P53540	846 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SHR3	Q02774	210 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MFB1	Q04922	465 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ECI1	Q05871	280 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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