RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	SNF8	Q12483	233 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CMK2	P22517	447 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-C	P25383	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	DMC1	P25453	334 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SEC17	P32602	292 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TFB1	P32776	642 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SPO23	P33757	523 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	GLG1	P36143	616 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CBP4	P37267	147 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PFS1	P38872	237 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CAB2	P40506	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SNL1	P40548	159 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SSU1	P41930	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	BIO3	P50277	480 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	RMR1	P53060	241 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	GPG1	P53130	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	DSL1	P53847	754 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YNL140C	P53910	189 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YNL095C	P53932	642 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SPR6	Q01684	191 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	VPS74	Q06385	345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	GPI11	Q06636	219 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MFG1	Q07684	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YLL007C	Q07799	665 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-B	Q12260	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PSY3	Q12318	242 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	RAD7	P06779	565 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	UNG1	P12887	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SNF4	P12904	322 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CLB4	P24871	460 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	RIB1	P38066	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	VRG4	P40107	337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	APQ12	P40532	138 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	BIT61	P47041	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YNR068C	P53754	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YDR239C	Q03780	787 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PEX12	Q04370	399 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YKU80	Q04437	629 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MDM35	O60200	86 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	ATP4	P05626	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	GAL3	P13045	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	ATR1	P13090	542 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PPH21	P23594	369 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PEX3	P28795	441 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MEI5	P32489	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	CDC5	P32562	705 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YPT7	P32939	208 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SRX1	P36077	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	RCK1	P38622	512 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MET30	P39014	640 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YIL077C	P40508	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MNT3	P40549	630 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	PMT4	P46971	762 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	YJL043W	P47053	257 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	GOR1	P53839	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	IGO1	P53897	168 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	SWF1	Q04629	336 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	ROY1	Q04847	553 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	USV1	Q12132	391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
ROX3	YBL093C	YLR111W	Q12528	110 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ROX3	YBL093C	MHF2	Q3E829	80 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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