RNA–Protein interactions for RNA: Q0065

AI4, Transcript of Endonuclease I-SceII, yeast

Gene AI4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI4	Q0065	LDS2	Q08218	356 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	YRM1	Q12340	786 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	DAP2	P18962	818 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	RPB5	P20434	215 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	ANP1	P32629	500 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	YNR068C	P53754	272 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	YMR102C	Q03177	834 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	IRC25	Q07951	179 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	OPI3	P05375	206 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	CYC3	P06182	269 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
AI4	Q0065	NAM9	P27929	486 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	YEL043W	P32618	956 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	YHR131C	P38835	850 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	MRM2	P53123	320 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	NUP116	Q02630	1113 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	PGC1	Q08959	321 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	JID1	Q12350	301 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	SBE22	P38814	852 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	PAN6	P40459	309 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	PMT5	P52867	743 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	PEX27	Q08580	376 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	EAF3	Q12432	401 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	MAS2	P11914	482 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	PRR1	P28708	518 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	PSO2	P30620	661 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	TOA2	P32774	122 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	SIF2	P38262	535 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	HAC1	P41546	238 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	AIM24	P47127	394 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	CLD1	P53264	445 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	RRN9	P53437	365 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	RET3	P53600	189 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	ASA1	Q06822	443 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AI4	Q0065	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	NAM2	P11325	894 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	MSI1	P13712	422 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	MSK1	P32048	576 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	SMI1	P32566	505 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	MSG5	P38590	489 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	GEP4	P38812	185 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	SPG5	P42933	373 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	EFM3	P47163	339 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	PRM1	P53835	661 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YNL143C	P53908	130 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	AQR1	P53943	586 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YDL114W	Q07530	308 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	FDH1	Q08911	376 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	RSA1	Q08932	381 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	TMS1	Q12116	473 aa		3.02	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	HMX1	P32339	317 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	TIR2	P33890	251 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YIL089W	P40500	205 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	SNL1	P40548	159 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YFR057W	P43625	151 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	MGR3	Q04472	501 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YDR286C	Q05530	114 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YKL097C	P34245	136 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	GPX2	P38143	162 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YHR177W	P38867	453 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	MST27	P53176	234 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	COS1	P53822	381 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	ADA2	Q02336	434 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	AHC1	Q12433	566 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	PCL9	Q12477	304 aa		3.01	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	YHK8	P38776	514 aa		3	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AI4	Q0065	SEC9	P40357	651 aa		3	□□□□□ -1.93

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