RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YDR249C	Q03787	373 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	URH1	Q04179	340 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RAD33	Q04231	177 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YDR514C	Q04408	483 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DCR2	Q05924	578 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPR172W	Q06608	200 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RDR1	Q08904	546 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	UBX3	Q12229	455 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RUP1	Q12242	671 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RTR2	Q12378	196 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COX5A	P00424	153 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RSR1	P13856	272 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CUP2	P15315	225 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PUT4	P15380	627 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PHO81	P17442	1178 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CBP3	P21560	335 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SAN1	P22470	610 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CLB1	P24868	471 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	POL4	P25615	582 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PEP3	P27801	918 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.39	□□□□□ -2.35	not detected
AI1	Q0050	SWH1	P35845	1188 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YBP1	P38315	674 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TSC10	P38342	320 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARN2	P38724	620 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RTS2	P40962	232 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NNF1	P47149	201 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	KAP114	P53067	1004 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YGR066C	P53242	292 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RNH70	P53331	553 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	KTR6	P54070	446 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BET4	Q00618	327 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ATG21	Q02887	496 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TAF12	Q03761	539 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CSI1	Q04368	295 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RAF1	Q06891	181 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SPO75	Q07798	868 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	LDB18	Q07887	179 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PSR2	Q07949	397 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PEX15	Q08215	383 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	UIP4	Q08926	304 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PFA4	Q12006	378 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TRM8	Q12009	286 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BPH1	P25356	2167 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DIF1	O13577	133 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.38	□□□□□ -2.35	not detected
AI1	Q0050	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	UNG1	P12887	359 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SLY1	P22213	666 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SPC110	P32380	944 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.38	□□□□□ -2.35	not detected
AI1	Q0050	ECM25	P32525	599 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GPI18	P38211	433 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YBR096W	P38256	230 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PCL6	P40038	420 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RIC1	P40395	1056 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TMA108	P40462	946 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	POP1	P41812	875 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CAF16	P43569	289 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PET130	P47065	347 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YGR153W	P48238	217 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NIT3	P49954	291 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HOP2	P53187	214 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COS1	P53822	381 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YLR460C	P54007	376 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RSM28	Q03430	361 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARP10	Q04549	284 aa		0.38	□□□□□ -2.35

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