RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W IRA2P19158 3079 aa8.36□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CLB3P24870 427 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W UBC8P28263 218 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CWP1P28319 239 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YMC1P32331 307 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W OAR1P35731 278 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YBR285WP38354 144 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W LYS12P40495 371 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W GPI8P49018 411 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W SED5Q01590 340 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W REC102Q02721 264 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W RRN5Q02983 363 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YLR346CQ06139 101 aa8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
DDI1YER143W HTS1P07263 546 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CTR86P25355 563 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CHA1P25379 360 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W GSH1P32477 678 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W CYS4P32582 507 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W MRPL6P32904 214 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W HCS1P34243 683 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YRB2P40517 327 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W OPT2Q06593 877 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W SWA2Q06677 668 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W YLR030WQ07967 263 aa8.34□□□□□ -1.07
DDI1YER143W MF(ALPHA)1P01149 165 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W HOP1P20050 605 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W TUL1P36096 758 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W MTG2P38860 518 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W THO1P40040 218 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YJL068CP40363 299 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W CFD1P40558 293 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YFL066CP43538 392 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W HOC1P47124 396 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W STE24P47154 453 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RSF1Q05043 376 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RSA1Q08932 381 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W VIK1Q12045 647 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W TSC13Q99190 310 aa8.33□□□□□ -1.08
DDI1YER143W CAN1P04817 590 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W GPH1P06738 902 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W GRR1P24814 1151 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YCR006CP25350 157 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W SAC1P32368 623 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W HOG1P32485 435 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W LOT5P34234 306 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YRO2P38079 344 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W ECM8P38246 354 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W PRE6P40303 254 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YGR201CP42936 225 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W IBA57P47158 497 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W ARO10Q06408 635 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W DCI1Q08558 271 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W SKM1Q12469 655 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W SKS1Q12505 502 aa8.32□□□□□ -1.08
DDI1YER143W TEC1P18412 486 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RPB5P20434 215 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RHB1P25378 209 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W IMG1P25626 169 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W PTR2P32901 601 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W PET112P33893 541 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W TIF3P34167 436 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W AHP1P38013 176 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W PRP39P39682 629 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W DAM1P53267 343 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YNL181WP53878 407 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W ERG13P54839 491 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RAD30Q04049 632 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W GIC2Q06648 383 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W SFM1Q12314 213 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RIB3Q99258 208 aa8.31□□□□□ -1.08
DDI1YER143W FAR1P21268 830 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data8.3□□□□□ -1.08not detected
DDI1YER143W GLY1P37303 387 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W GIP2P40036 548 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YIL086CP40503 102 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W MPH1P40562 993 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W FAR7P43592 221 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W BIT61P47041 543 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W NRM1P53718 249 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RSC9Q03124 581 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RIM13Q03792 727 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W DIC1Q06143 298 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W BSC6Q08280 497 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W MRX4Q12467 430 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YPL119C-AQ3E751 87 aa8.3□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YOR019WQ99248 730 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.7 ms