RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	TIS11	P47977	285 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	FYV6	P53913	173 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	TPO4	Q12256	659 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	PSY3	Q12318	242 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	PDE2	P06776	526 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	MSS18	P08593	268 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	ALY1	P36117	915 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	OSH7	P38755	437 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YHR218W	P38899	603 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	CCT6	P39079	546 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	APQ12	P40532	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YIR007W	P40566	764 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	HSP31	Q04432	237 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	BNA5	Q05979	453 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	OSW1	Q08692	278 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	FAB1	P34756	2278 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	KIN28	P06242	306 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SIR3	P06701	978 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RIB5	P38145	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	ALP1	P38971	573 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	GCD10	P41814	478 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SWF1	Q04629	336 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	GAS2	Q06135	555 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	THI73	Q07904	523 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	IRC23	Q08416	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	VPS68	Q12016	184 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	GRR1	P24814	1151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	HCM1	P25364	564 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	CWP1	P28319	239 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YHL012W	P38709	493 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YPS6	P40583	537 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	OTU1	P43558	301 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
PDR10	YOR328W	IRC15	Q02733	499 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YKU80	Q04437	629 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	AIM6	Q07716	390 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	MCH5	Q08777	521 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	MDM12	Q92328	271 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	TRX3	P25372	127 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	UBC8	P28263	218 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SEC61	P32915	480 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	LAG1	P38703	411 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	UBA4	P38820	440 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SKN7	P38889	622 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SSY5	P47002	699 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YNL033W	P53964	284 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YNL019C	P53975	284 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YSA1	Q01976	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	PDR8	Q06149	701 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	VPS36	Q06696	566 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SCM3	Q12334	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	AI4	P03878	556 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SAN1	P22470	610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	PMT1	P33775	817 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SET3	P36124	751 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	TIM17	P39515	158 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	FAA2	P39518	744 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	NEO1	P40527	1151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	GLC8	P41818	229 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	YJL055W	P47044	245 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	MSC1	Q03104	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	SKS1	Q12505	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RAD6	P06104	172 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	STE4	P18851	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	MRPS28	P21771	286 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	AGP1	P25376	633 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	CSM1	P25651	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	TFB1	P32776	642 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	IBA57	P47158	497 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	URA3	P03962	267 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	PTP1	P25044	335 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDR10	YOR328W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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