RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	YSW1	P38280	609 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	INM1	P38710	295 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	GPI16	P38875	610 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YJL213W	P40896	331 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	TOF1	P53840	1238 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MEH1	Q02205	184 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YFH1	Q07540	174 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	PGC1	Q08959	321 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	RAD61	Q99359	647 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	DST1	P07273	309 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SPO12	P17123	173 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	ITR1	P30605	584 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
HMS1	YOR032C	NAT2	P37293	288 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	RIB5	P38145	238 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YIP5	P53108	310 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	STD1	Q02794	444 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YMR181C	Q03231	154 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SRN2	Q99176	213 aa		4	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SPS22	P25380	463 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.99	□□□□□ -1.77	not detected
HMS1	YOR032C	MRP4	P32902	394 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	KKQ8	P36004	724 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	QDR3	P38227	689 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MNL1	P38888	796 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YAT2	P40017	923 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	PAC11	P40960	533 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YDL186W	P48568	277 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	IBD2	P53892	351 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	IMA2	Q08295	589 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	NDD1	Q08887	554 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SRL2	Q12020	392 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	PPT2	Q12036	173 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	DAP2	P18962	818 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YSC83	P32792	385 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YBP1	P38315	674 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MEP2	P41948	499 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YFL067W	P43537	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	WSC2	P53832	503 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	IPK1	Q06667	281 aa		3.98	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SLY1	P22213	666 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SMI1	P32566	505 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SKN1	P33336	771 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	UIP5	P36137	443 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MIX23	P38162	196 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YBL028C	P38202	106 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SIF2	P38262	535 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	FAA2	P39518	744 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	CHS6	P40955	746 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	GOR1	P53839	350 aa		3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	STP2	P38704	541 aa		3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	IDP2	P41939	412 aa		3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	AZR1	P50080	613 aa		3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YGL260W	P53056	76 aa		3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	RTT102	P53330	157 aa		3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	HEM15	P16622	393 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	MTC6	P38849	526 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	SFH5	P47008	294 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	HXT11	P54862	567 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	URC2	Q04411	772 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	ECM7	Q06200	448 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	AAD15	Q08361	143 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	HNT3	Q08702	217 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.95	□□□□□ -1.78
HMS1	YOR032C	RNH203	Q12338	110 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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