RNA–Protein interactions for RNA: YNL077W

APJ1, Transcript of Chaperone with a role in SUMO-mediated protein degradation, yeast

Gene APJ1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	YNL077W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MRP13	P12686	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PRI2	P20457	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SAN1	P22470	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MEF1	P25039	761 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PTP1	P25044	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	CSM1	P25651	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	CDC5	P32562	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PET127	P32606	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SPO23	P33757	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	HES1	P35843	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MRPL17	P36528	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	APT2	P36973	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MPH1	P40562	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	IMA5	P40884	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MAD2	P40958	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
APJ1	YNL077W	MSE1	P48525	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	BIO3	P50277	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SDT1	P53078	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	HSP31	Q04432	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	BCP1	Q06338	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RUP1	Q12242	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ARG3	P05150	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ATP4	P05626	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TPK2	P06245	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	HOP1	P20050	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	HOG1	P32485	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	LST4	P34239	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ROT2	P38138	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ALG3	P38179	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	IST2	P38250	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	EHT1	P38295	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ALG5	P40350	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GAB1	P41733	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MUP1	P50276	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	DIA3	P52290	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RTS3	P53289	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MMT1	Q03218	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ACL4	Q03771	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SWF1	Q04629	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	NTO1	Q12311	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SKM1	Q12469	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YPR096C	O13587	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RAP1	P11938	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SEC17	P32602	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GLG1	P36143	616 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YHR112C	P38716	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	BEM4	P39011	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	MAM33	P40513	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	CFD1	P40558	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PRM10	P42946	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YFL054C	P43549	646 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GOR1	P53839	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RRN11	Q04712	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PDR8	Q06149	701 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GGA1	Q06336	557 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	VPS74	Q06385	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	REX4	Q08237	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	GET4	Q12125	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	NFI1	Q12216	726 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RPN6	Q12377	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	SNF8	Q12483	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	TOP3	P13099	656 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APJ1	YNL077W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms