RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	SPO22	P40511	975 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	PET130	P47065	347 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YGR066C	P53242	292 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	MDM1	Q01846	1127 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YPL199C	Q08954	240 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YLR108C	Q12259	485 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	RRD2	Q12461	358 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.95	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	MET8	P15807	274 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	PIM1	P36775	1133 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	RXT2	P38255	430 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	ODC1	Q03028	310 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	SPH1	Q06160	661 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	MED1	Q12321	566 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	ERP3	Q12403	225 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	MRE11	P32829	692 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	SDH3	P33421	198 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	MIX23	P38162	196 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	URB2	P47108	1174 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	FMS1	P50264	508 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YGL138C	P53122	345 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	VPS75	P53853	264 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	IBD2	P53892	351 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	ARP5	P53946	755 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	VPS20	Q04272	221 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YMR321C	Q04898	105 aa		2.93	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	TAO3	P40468	2376 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	FOB1	O13329	566 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
PEX18	YHR160C	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
PEX18	YHR160C	YEL057C	P39983	233 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	NCA3	P46955	337 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YGL108C	P53139	140 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	LIF1	P53150	421 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	LSB1	P53281	241 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	PNG1	Q02890	363 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	VPS72	Q03388	795 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	AIM33	Q04516	312 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	CCH1	P50077	2039 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	POX1	P13711	748 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	STB6	P36085	766 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YCR041W	P37265	110 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	THI2	P38141	450 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	GAA1	P39012	614 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	PRM5	P40476	318 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	TIM10	P87108	93 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YDR239C	Q03780	787 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	COG4	Q06096	861 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	YPL150W	Q12152	901 aa		2.91	□□□□□ -1.94
PEX18	YHR160C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MAS2	P11914	482 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	ATP10	P18496	279 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SAS3	P34218	831 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	UIP5	P36137	443 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	CBP4	P37267	147 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	OPY1	P38271	328 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	YBR225W	P38321	900 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	NDE1	P40215	560 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MET28	P40573	187 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RET3	P53600	189 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	SOV1	Q04748	898 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PET123	P17558	318 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	RIB5	P38145	238 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	MST28	P39552	234 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	ESL1	P40456	1118 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PEX18	YHR160C	PAN6	P40459	309 aa		2.89	□□□□□ -1.95

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