RNA–Protein interactions for RNA: YNL143C

YNL143C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNL143C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL143C	YNL143C	YCR041W	P37265	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	OSW5	P40219	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	AZF1	P41696	914 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YIP1	P53039	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	MGR3	Q04472	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	IPK1	Q06667	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	NSE1	Q07913	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	RUP1	Q12242	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	SRN2	Q99176	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	STE3	P06783	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	EXO70	P19658	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	RAD57	P25301	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	FRE2	P36033	711 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	PCH2	P38126	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	MSG5	P38590	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	INM1	P38710	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	RTT107	P38850	1070 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	SPC97	P38863	823 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YIR016W	P40572	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	MDV1	P47025	714 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	GPI15	P53961	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	IRC15	Q02733	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	URH1	Q04179	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	CDC21	P06785	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	RDS1	P25611	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	SRB2	P34162	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	HMS2	P47175	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YGL082W	P53155	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	ARK1	P53974	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	STP1	Q00947	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	PNG1	Q02890	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	VTI1	Q04338	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	MLH2	Q07980	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	ORT1	Q12375	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	GLN3	P18494	730 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	HNM1	P19807	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YHR177W	P38867	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	PCL7	P40186	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	GWT1	P47026	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	PHB2	P50085	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	MPS2	P53159	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	ATG34	Q12292	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	RNH203	Q12338	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL143C	YNL143C	YCR100C	P25606	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YNL143C	YNL143C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YIL152W	P40455	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YIR014W	P40570	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	PAC11	P40960	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	GCD10	P41814	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	BRO1	P48582	844 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	VPS74	Q06385	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YEH2	Q07950	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	REX4	Q08237	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	MDY2	Q12285	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	RMD5	Q12508	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	DST1	P07273	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	SAG1	P20840	650 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YCR022C	P25620	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	PSO2	P30620	661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	RSM22	P36056	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	FRE4	P53746	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	PRM1	P53835	661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	NUP53	Q03790	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	ECM7	Q06200	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	DSE3	Q08729	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	OPI3	P05375	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	SPO12	P17123	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL143C	YNL143C	LSB5	P25369	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.1 ms