RNA–Protein interactions for RNA: YGR110W

CLD1, Transcript of Mitochondrial cardiolipin-specific phospholipase, yeast

Gene CLD1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLD1	YGR110W	MED2	Q12124	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	SWH1	P35845	1188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	RSM22	P36056	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	RRN10	P38204	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ELP2	P42935	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	AVT4	P50944	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	DAP1	Q12091	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	NFI1	Q12216	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	PMR1	P13586	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	SAD1	P43589	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YGR016W	P53209	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	PNG1	Q02890	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	AYT1	Q12226	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ORT1	Q12375	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	CTR86	P25355	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	SPC110	P32380	944 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	PFF1	P38244	976 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	RPR2	P40571	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	RTT101	P47050	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	PHB2	P50085	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ICT1	Q12385	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	ITR1	P30605	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	NDI1	P32340	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TMT1	P32643	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
CLD1	YGR110W	RRT5	P43607	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	HMS2	P47175	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	FRE4	P53746	719 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLD1	YGR110W	DRS2	P39524	1355 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	CAJ1	P39101	391 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	ODC1	Q03028	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	PIR3	Q03180	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	NUP53	Q03790	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	HEM2	P05373	342 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	ALG1	P16661	449 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	DAP2	P18962	818 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	PMU1	P36069	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	GPI16	P38875	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	MLH1	P38920	769 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	ALG8	P40351	577 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	YJL070C	P40361	888 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	PIB2	P53191	635 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	MEH1	Q02205	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TAF12	Q03761	539 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	PPM1	Q04081	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	BUG1	Q12191	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	SKS1	Q12505	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	SPT7	P35177	1332 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	YSW1	P38280	609 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	STP2	P38704	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	YAL037W	P39728	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	RPH1	P39956	796 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	YPS6	P40583	537 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLD1	YGR110W	POP6	P53218	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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