RNA–Protein interactions for RNA: YJL198W

PHO90, Transcript of Low-affinity phosphate transporter, yeast

Gene PHO90, Length 2,646 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO90	YJL198W	REC102	Q02721	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SPH1	Q06160	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YPS7	Q06325	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RTN2	Q12443	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SPE1	P08432	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SNF3	P10870	884 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SNF5	P18480	905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	HNM1	P19807	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SIR1	P21691	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	KAR4	P25583	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SPT14	P32363	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PDR3	P33200	976 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	APT2	P36973	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CDS1	P38221	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	POP4	P38336	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PPE1	P38796	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AIM2	P39721	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SOK1	P40317	901 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AGE2	P40529	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GSH2	Q08220	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	DIF1	O13577	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	BAR1	P12630	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CKA2	P19454	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RIT1	P23796	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PTC1	P35182	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CTF13	P35203	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	JEN1	P36035	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SDS22	P36047	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	FAA2	P39518	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MTW1	P39731	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YEL020C	P39994	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PEP8	P40335	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	THI6	P41835	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GET1	P53192	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GPN3	Q06543	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NDE2	Q07500	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	HRT3	Q12347	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	HMS1	Q12398	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	TPK1	P06244	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MDL2	P33311	773 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ALG14	P38242	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
PHO90	YJL198W	YER184C	P39961	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SLI1	P53304	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GAL83	Q04739	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ENT4	Q07872	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PEX27	Q08580	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	REX3	Q12090	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AVL9	Q12500	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RIF1	P29539	1916 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	TPK3	P05986	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	APE1	P14904	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ERS1	P17261	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CDC20	P26309	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	FLR1	P38124	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GPX2	P38143	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CTP1	P38152	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PHO89	P38361	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ATG7	P38862	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GPI1	P53306	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	NHP10	Q03435	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YML037C	Q03703	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	UFO1	Q04511	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YPR1	Q12458	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GCN4	P03069	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	FPS1	P23900	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	DBF4	P32325	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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